RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556416.1

CLMN-205, Transcript of calmin, humanhuman

TSL 2

Gene CLMN, Length 1,772 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMN-205ENST00000556416 KCNK16Q96T55 309 aa24.73■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa24.73■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 CYLDQ9NQC7 956 aa24.73■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 RWDD3Q9Y3V2 267 aa24.73■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 SCINQ9Y6U3 715 aa24.73■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 ADAM12O43184 909 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 HADHBP55084 474 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 GSCP56915 257 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 GPR17Q13304 367 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 MAMLD1Q13495 774 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 CFAP221Q4G0U5 840 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 SLC8B1Q6J4K2 584 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 SYT10Q6XYQ8 523 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 C3orf20Q8ND61 904 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 HSFY1Q96LI6 401 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 C17orf80Q9BSJ5 609 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 MIS12Q9H081 205 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 PARVAQ9NVD7 372 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 WDR35Q9P2L0 1181 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 GOLGA8SH3BPF8 625 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 GJB6O95452 261 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 CA3P07451 260 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 CYP2F1P24903 491 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 DNAJB2P25686 324 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 SNX16P57768 344 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 SPRED2Q7Z698 418 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 TRIM58Q8NG06 486 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 AUTS2Q8WXX7 1259 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 ALS2CR12Q96Q35 445 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 ZBP1Q9H171 429 aa24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 GRID2IPA4D2P6 1211 aa24.71■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 MTMR11A4FU01 709 aa24.71■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 OR1D2P34982 312 aa24.71■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 ACADSBP45954 432 aa24.71■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 ROR1Q01973 937 aa24.71■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa24.71■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 KCTD13Q8WZ19 329 aa24.71■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 MCRS1Q96EZ8 462 aa24.71■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 CLSTN3Q9BQT9 956 aa24.71■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 PLVAPQ9BX97 442 aa24.71■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 DNAI1Q9UI46 699 aa24.71■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa24.71■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 PALMO75781 387 aa24.7■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 LCP1P13796 627 aa24.7■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 OR6B2Q6IFH4 312 aa24.7■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 ATAD1Q8NBU5 361 aa24.7■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 ABCB6Q9NP58 842 aa24.7■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
CLMN-205ENST00000556416 MYO16Q9Y6X6 1858 aa24.7■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 WDR27A2RRH5 827 aa24.7■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 HHLA1C9JL84 531 aa24.7■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 F8VP50 259 aa24.7■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 FANCGO15287 622 aa24.7■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 VNN2O95498 520 aa24.7■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 TUBB4AP04350 444 aa24.7■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 ADIGQ0VDE8 80 aa24.7■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 SMARCB1Q12824 385 aa24.7■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa24.7■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 TTC9BQ8N6N2 239 aa24.7■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 SELENOOQ9BVL4 669 aa24.7■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 UBXN6Q9BZV1 441 aa24.7■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 TRIM7Q9C029 511 aa24.7■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 ANAPC7Q9UJX3 599 aa24.7■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 MTUS1Q9ULD2 1270 aa24.7■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 CTSAP10619 480 aa24.69■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 GRIK1P39086 918 aa24.69■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa24.69■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 SCUBE3Q8IX30 993 aa24.69■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 GPR65Q8IYL9 337 aa24.69■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 LRRC57Q8N9N7 239 aa24.69■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 FEZF2Q8TBJ5 459 aa24.69■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 SPPL2BQ8TCT7 592 aa24.69■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 BTBD6Q96KE9 485 aa24.69■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 MCEEQ96PE7 176 aa24.69■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 GOLPH3Q9H4A6 298 aa24.69■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 LRRC4Q9HBW1 653 aa24.69■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 LZTS1Q9Y250 596 aa24.69■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 MAGEA11P43364 429 aa24.68■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 OLFML1Q6UWY5 402 aa24.68■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 VSTM1Q6UX27 236 aa24.68■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 SCN4BQ8IWT1 228 aa24.68■■□□□ 1.54
CLMN-205ENST00000556416 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.6 ms