RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FGF13Q92913 245 aa13.66□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GCNAQ96QF7 691 aa13.66□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MYADMQ96S97 322 aa13.66□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TSPY26PQ9H489 355 aa13.66□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GDE1Q9NZC3 331 aa13.66□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CDH7Q9ULB5 785 aa13.66□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa13.66□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MOSPD3O75425 235 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LAMP2P13473 410 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KRT5P13647 590 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CD19P15391 556 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NPR3P17342 541 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CEBPBP17676 345 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GABRR2P28476 465 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF445P59923 1031 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UBXN1Q04323 297 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MTMR3Q13615 1198 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CLEC20AQ6ZU45 233 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GAREM2Q75VX8 874 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 STKLD1Q8NE28 680 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SHKBP1Q8TBC3 707 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ING5Q8WYH8 240 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SHC3Q92529 594 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TCEAL4Q96EI5 215 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ERGIC2Q96RQ1 377 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KCNK16Q96T55 309 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SMOQ99835 787 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TTLL2Q9BWV7 592 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DUSP16Q9BY84 665 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IL21Q9HBE4 155 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PNPLA8Q9NP80 782 aa13.65□□□□□ -0.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DNAJC12Q9UKB3 198 aa13.65□□□□□ -0.22
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A1W2PRU2 124 aa13.64□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 O00370 1275 aa13.64□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UCHL3P15374 230 aa13.64□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MAP3K7CLP57077 242 aa13.64□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC8A3P57103 927 aa13.64□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SYCP1Q15431 976 aa13.64□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 STILQ15468 1287 aa13.64□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TEAD2Q15562 447 aa13.64□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARHGAP44Q17R89 818 aa13.64□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FILIP1LQ4L180 1135 aa13.64□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa13.64□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NUP93Q8N1F7 819 aa13.64□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ANKRD52Q8NB46 1076 aa13.64□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZMIZ2Q8NF64 920 aa13.64□□□□□ -0.23
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 GPR88Q9GZN0 384 aa13.64□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ATXN3LQ9H3M9 355 aa13.64□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 COMMD8Q9NX08 183 aa13.64□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HESX1Q9UBX0 185 aa13.64□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZMYM5Q9UJ78 669 aa13.64□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TSPAN16Q9UKR8 245 aa13.64□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SIK3Q9Y2K2 1263 aa13.64□□□□□ -0.23
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A1B0GTH6 734 aa13.63□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SOBPA7XYQ1 873 aa13.63□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TNFRSF10BO14763 440 aa13.63□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BEST1O76090 585 aa13.63□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SERPINC1P01008 464 aa13.63□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 F11P03951 625 aa13.63□□□□□ -0.23
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 BCAT1P54687 386 aa13.63□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 USP46P62068 366 aa13.63□□□□□ -0.23
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 LCLAT1Q6UWP7 414 aa13.63□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MTSS1LQ765P7 747 aa13.63□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM150AQ86TG1 271 aa13.63□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TFAP2BQ92481 460 aa13.63□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UBXN6Q9BZV1 441 aa13.63□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GANQ9H2C0 597 aa13.63□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CD320Q9NPF0 282 aa13.63□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IL37Q9NZH6 218 aa13.63□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGSF9Q9P2J2 1179 aa13.63□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP13.63□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NCANO14594 1321 aa13.63□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM92AA1XBS5 289 aa13.62□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HHLA1C9JL84 531 aa13.62□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ANHXE9PGG2 379 aa13.62□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ABCB7O75027 752 aa13.62□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TADA3O75528 432 aa13.62□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SETSIPP0DME0 302 aa13.62□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GJA1P17302 382 aa13.62□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BRD2P25440 801 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GNA15P30679 374 aa13.62□□□□□ -0.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 USP8P40818 1118 aa13.62□□□□□ -0.23
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