RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552915.5

CNOT2-241, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

TSL 5

Gene CNOT2, Length 1,071 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2-241ENST00000552915 OR4Q2P0C623 313 aa12.87□□□□□ -0.35
CNOT2-241ENST00000552915 MYOGP15173 224 aa12.87□□□□□ -0.35
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CNOT2-241ENST00000552915 ABCB4P21439 1286 aa12.87□□□□□ -0.35
CNOT2-241ENST00000552915 MAGEA1P43355 309 aa12.87□□□□□ -0.35
CNOT2-241ENST00000552915 KRT83P78385 493 aa12.87□□□□□ -0.35
CNOT2-241ENST00000552915 TSPY1Q01534 308 aa12.87□□□□□ -0.35
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CNOT2-241ENST00000552915 RTP2Q5QGT7 225 aa12.86□□□□□ -0.35
CNOT2-241ENST00000552915 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CNOT2-241ENST00000552915 LIMS2Q7Z4I7 341 aa12.86□□□□□ -0.35
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CNOT2-241ENST00000552915 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa12.86□□□□□ -0.35
CNOT2-241ENST00000552915 A0A0U1RQJ8 604 aa12.85□□□□□ -0.35
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CNOT2-241ENST00000552915 H7C4K7 107 aa12.85□□□□□ -0.35
CNOT2-241ENST00000552915 O00370 1275 aa12.85□□□□□ -0.35
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CNOT2-241ENST00000552915 FAM163BP0C2L3 166 aa12.85□□□□□ -0.35
CNOT2-241ENST00000552915 BMP2P12643 396 aa12.85□□□□□ -0.35
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CNOT2-241ENST00000552915 ZNF653Q96CK0 615 aa12.85□□□□□ -0.35
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CNOT2-241ENST00000552915 VN1R3Q9BXE9 311 aa12.85□□□□□ -0.35
CNOT2-241ENST00000552915 PACSIN1Q9BY11 444 aa12.85□□□□□ -0.35
CNOT2-241ENST00000552915 ST7Q9NRC1 585 aa12.85□□□□□ -0.35
CNOT2-241ENST00000552915 KIAA1257Q9ULG3 409 aa12.85□□□□□ -0.35
CNOT2-241ENST00000552915 ATP8B3O60423 1300 aa12.85□□□□□ -0.35
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