RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 LRRC52Q8N7C0 313 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 TMEM174Q8WUU8 243 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 NELL1Q92832 810 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 FGF14Q92915 247 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 GBP4Q96PP9 640 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 LTB4R2Q9NPC1 389 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 SCN1AP35498 2009 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 DOCK6Q96HP0 2047 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 ARHGEF37A1IGU5 675 aa10.31□□□□□ -0.76
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CS-217ENST00000550044 SOWAHAQ2M3V2 549 aa10.31□□□□□ -0.76
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CS-217ENST00000550044 EDRF1Q3B7T1 1238 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 SLC44A4Q53GD3 710 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 COBLL1Q53SF7 1204 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 C1orf220Q5T0J3 134 aa10.31□□□□□ -0.76
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CS-217ENST00000550044 TPGS2Q68CL5 300 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 PARM1Q6UWI2 310 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 PRR23BQ6ZRT6 265 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 LRRTM3Q86VH5 581 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 FAM186BQ8IYM0 893 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 PDCL2Q8N4E4 241 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 ATAD1Q8NBU5 361 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 OR10T2Q8NGX3 314 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 MMS19Q96T76 1030 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 TSG101Q99816 390 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 MMRN2Q9H8L6 949 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 GDAP2Q9NXN4 497 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 DSEQ9UL01 958 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 L1RE1Q9UN81 338 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 IGF2RP11717 2491 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 PSMA7O14818 248 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 MAPK13O15264 365 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 VNN1O95497 513 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 VNN2O95498 520 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 LRG1P02750 347 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 TRIM49P0CI25 452 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 TRIM49CP0CI26 452 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 TARSP26639 723 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 GCLMP48507 274 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 STX17P56962 302 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 CLDN10P78369 228 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 DUSP4Q13115 394 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 GPR17Q13304 367 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 WDR72Q3MJ13 1102 aa10.3□□□□□ -0.76
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CS-217ENST00000550044 SLC39A12Q504Y0 691 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 LAIR1Q6GTX8 287 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 PRR23CQ6ZRP0 262 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 SV2AQ7L0J3 742 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 OSTM1Q86WC4 334 aa10.3□□□□□ -0.76
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CS-217ENST00000550044 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 OSBPL6Q9BZF3 934 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 CRISPLD1Q9H336 500 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 SEMA4GQ9NTN9 838 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 CTNND2Q9UQB3 1225 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 MTMR11A4FU01 709 aa10.29□□□□□ -0.76
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CS-217ENST00000550044 RETP07949 1114 aa10.29□□□□□ -0.76
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CS-217ENST00000550044 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP10.29□□□□□ -0.76
CS-217ENST00000550044 EPB41P11171 864 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
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