RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547201.5

USP25-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 2

Gene USP25, Length 757 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-209ENST00000547201 HCRTO43612 131 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 LPXNO60711 386 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 CAND2O75155 1236 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 TBCAO75347 108 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 GJB5O95377 273 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 GCNT3O95395 438 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 KRT18P05783 430 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 CXCL8P10145 99 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.446e-6■■■■■ 31.4
USP25-209ENST00000547201 MCM4P33991 863 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 CASP4P49662 377 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 UBE2HP62256 183 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 TAP1Q03518 808 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 PTPN21Q16825 1174 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 C1orf220Q5T0J3 134 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 CD300LGQ6UXG3 332 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 UNC13DQ70J99 1090 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 ZNF720Q7Z2F6 126 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 CBWD2Q8IUF1 395 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 EFCAB13Q8IY85 973 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 USP38Q8NB14 1042 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 CNNM3Q8NE01 707 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 SPATA20Q8TB22 786 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 HASPINQ8TF76 798 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 TCP11Q8WWU5 503 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 SEPT8Q92599 483 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 KIFAP3Q92845 792 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 GUCD1Q96NT3 240 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 GAD1Q99259 594 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 CWH43Q9H720 699 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 PARVGQ9HBI0 331 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 MARCH5Q9NX47 278 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 SNTG2Q9NY99 539 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 CDH22Q9UJ99 828 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 MYO7AQ13402 2215 aa6.05□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 A0A1B0GUA9 196 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 B8ZZF3 427 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 I3L4J1 428 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 M0QZ92 97 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 ACKR2O00590 384 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 SEMA7AO75326 666 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 CILPO75339 1184 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 OFD1O75665 1012 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 DGKIO75912 1065 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 POMCP01189 267 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 VAMP1P23763 118 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 TMOD1P28289 359 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 RFC2P35250 354 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 PRCPP42785 496 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 ACOT2P49753 483 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 STX17P56962 302 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 DLG4P78352 724 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 FAM189BP81408 668 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 GTF2BQ00403 316 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 CHRNEQ04844 493 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 CAMK1Q14012 370 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 FAM187BQ17R55 369 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 ZNF605Q86T29 641 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 THNSL1Q8IYQ7 743 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 NME8Q8N427 588 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 IQUBQ8NA54 791 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 CXorf38Q8TB03 319 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 TOP1MTQ969P6 601 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 SNX27Q96L92 541 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 DRC1Q96MC2 740 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 NFKBIZQ9BYH8 718 aa6.04□□□□□ -1.44
USP25-209ENST00000547201 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms