RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	DGKH	Q86XP1	1220 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	TBC1D5	Q92609	795 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	TIFA	Q96CG3	184 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	COL20A1	Q9P218	1284 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF213	O14771	459 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	CCP110	O43303	1012 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	TJP3	O95049	919 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	3.72	□□□□□ -1.81	3e-7	■■■■□ 20.8
MDM2-233	ENST00000545204	FAM163B	P0C2L3	166 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	IL1R1	P14778	569 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	CCDC142	Q17RM4	750 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	INSC	Q1MX18	579 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	COLEC12	Q5KU26	742 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	SESTD1	Q86VW0	696 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	PADI4	Q9UM07	663 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	GABRQ	Q9UN88	632 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	AOX1	Q06278	1338 aa		3.71	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	WIPF3	A6NGB9	483 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	TARM1	B6A8C7	271 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	QSOX1	O00391	747 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	VNN1	O95497	513 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	ENG	P17813	658 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	CTGF	P29279	349 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	PDE1A	P54750	535 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	TPTE	P56180	551 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	NPY5R	Q15761	445 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	LY6K	Q17RY6	165 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	CEP85	Q6P2H3	762 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204		Q6ZWC4	215 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	SPART	Q8N0X7	666 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	KRT78	Q8N1N4	520 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	HASPIN	Q8TF76	798 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	VOPP1	Q96AW1	172 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	REPS1	Q96D71	796 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	STK31	Q9BXU1	1019 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	TRIM5	Q9C035	493 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204		H7C4K7	107 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	SRGAP2	O75044	1071 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	RASSF9	O75901	435 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	JTB	O76095	146 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	RASAL1	O95294	804 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	NPS	P0C0P6	89 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	ACVR2A	P27037	513 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	BCAT1	P54687	386 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	TFF2	Q03403	129 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	CCNI	Q14094	377 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	CYP1B1	Q16678	543 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	PCID2	Q5JVF3	399 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-233	ENST00000545204	FCRL6	Q6DN72	434 aa		3.7	□□□□□ -1.82

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