RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540240.1

C16orf62-212, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 633 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-212ENST00000540240 LRP3O75074 770 aa8.4□□□□□ -1.06
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C16orf62-212ENST00000540240 CNR2P34972 360 aa8.4□□□□□ -1.06
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C16orf62-212ENST00000540240 GDAQ9Y2T3 454 aa8.4□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
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C16orf62-212ENST00000540240 PSMC3P17980 439 aa8.39□□□□□ -1.07
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C16orf62-212ENST00000540240 TKTP29401 623 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
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C16orf62-212ENST00000540240 ROR1Q01973 937 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 MTAPQ13126 283 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 CDK5R2Q13319 367 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF124Q15973 351 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 LCE4AQ5TA78 99 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 ATF7IP2Q5U623 682 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 EEF1DP3Q658K8 133 aa8.39□□□□□ -1.07
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C16orf62-212ENST00000540240 KIFAP3Q92845 792 aa8.39□□□□□ -1.07
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C16orf62-212ENST00000540240 ZNF263O14978 683 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 MED24O75448 989 aa8.38□□□□□ -1.07
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C16orf62-212ENST00000540240 GDI1P31150 447 aa8.38□□□□□ -1.07
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C16orf62-212ENST00000540240 BRCC3P46736 316 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 CXCL12P48061 93 aa8.38□□□□□ -1.07
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C16orf62-212ENST00000540240 HAUS3Q68CZ6 603 aa8.38□□□□□ -1.07
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C16orf62-212ENST00000540240 CD300LGQ6UXG3 332 aa8.38□□□□□ -1.07
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C16orf62-212ENST00000540240 TRPV4Q9HBA0 871 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 WDR27A2RRH5 827 aa8.37□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 SHISA7A6NL88 538 aa8.37□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 PODXLO00592 558 aa8.37□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 SLC30A4O14863 429 aa8.37□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 TMPRSS2O15393 492 aa8.37□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 ADRB1P08588 477 aa8.37□□□□□ -1.07
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