RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538923.1

MRE11-208, Transcript of MRE11 homolog, double strand break repair nuclease, humanhuman

TSL 5

Gene MRE11, Length 558 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11-208ENST00000538923 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 OR10T2Q8NGX3 314 aa9.6□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 SPPL2BQ8TCT7 592 aa9.6□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 GAB3Q8WWW8 586 aa9.6□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 AK8Q96MA6 479 aa9.6□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 LPIN3Q9BQK8 851 aa9.6□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 REEP2Q9BRK0 252 aa9.6□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 ASB7Q9H672 318 aa9.6□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 PARVGQ9HBI0 331 aa9.6□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 C2orf42Q9NWW7 574 aa9.6□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 PPP4R2Q9NY27 417 aa9.6□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 C2CD2Q9Y426 696 aa9.6□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.6□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 CYB561D2O14569 222 aa9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 EXTL3O43909 919 aa9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 PRMT3O60678 531 aa9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 TBCAO75347 108 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 AKAP3O75969 853 aa9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 FAM13AO94988 1023 aa9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 CCDC192P0DO97 292 aa9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 BFSP1Q12934 665 aa9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 RUNX3Q13761 415 aa9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 TMEM196Q5HYL7 178 aa9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 GPBP1Q86WP2 473 aa9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 EXOC4Q96A65 974 aa9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 CALML4Q96GE6 196 aa9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 CHAMP1Q96JM3 812 aa9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 FAM83CQ9BQN1 747 aa9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 SLC46A2Q9BY10 475 aa9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 KIF9Q9HAQ2 790 aa9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 GKN1Q9NS71 199 aa9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 SLC8A2Q9UPR5 921 aa9.59□□□□□ -0.87
MRE11-208ENST00000538923 NCOR2Q9Y618 2525 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 GPR179Q6PRD1 2367 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 EPN2O95208 641 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 KRT18P05783 430 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 ZNF806P0C7X5 589 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 UBA7P41226 1012 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 RAP1GAPP47736 663 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 PXNP49023 591 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 ACOT2P49753 483 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 TAF6P49848 677 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 GTF2BQ00403 316 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 SV2CQ496J9 727 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 ADALQ6DHV7 355 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 SLFN12LQ6IEE8 588 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 SLC39A4Q6P5W5 647 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 CAMKK1Q8N5S9 505 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 GIPC2Q8TF65 315 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 CCSER1Q9C0I3 900 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 ZHX3Q9H4I2 956 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 EBF3Q9H4W6 596 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 TDP1Q9NUW8 608 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 DPP3Q9NY33 737 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa9.58□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 KPNA7A9QM74 516 aa9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 H3BQV1 296 aa9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 IL18RAPO95256 599 aa9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 CSH1P0DML2 217 aa9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 CSH2P0DML3 217 aa9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 DRD1P21728 446 aa9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 NMT1P30419 496 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 GMPRP36959 345 aa9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 PNPLA4P41247 253 aa9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 CDR1P51861 262 aa9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 NLRP12P59046 1061 aa9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 PDGFRLQ15198 375 aa9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 FBXO43Q4G163 708 aa9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 LCE2CQ5TA81 110 aa9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 WSCD1Q658N2 575 aa9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 FSTL4Q6MZW2 842 aa9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 TMEM150AQ86TG1 271 aa9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 KBTBD6Q86V97 674 aa9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 LRRTM3Q86VH5 581 aa9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 MAB21L3Q8N8X9 362 aa9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 RASSF8Q8NHQ8 419 aa9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
MRE11-208ENST00000538923 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms