RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	GRM2	Q14416	872 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NOMO1	Q15155	1222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	STEAP4	Q687X5	459 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PASD1	Q8IV76	773 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PQLC3	Q8N755	202 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	FBF1	Q8TES7	1133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MCEE	Q96PE7	176 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ZFAT	Q9P243	1243 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	DPYSL4	O14531	572 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ADCY3	O60266	1144 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	B4GALT4	O60513	344 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	LGR5	O75473	907 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	APOC2	P02655	101 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CALB1	P05937	261 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	IQCF3	P0C7M6	154 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NRL	P54845	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	AMHR2	Q16671	573 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	XKR3	Q5GH77	459 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM270	Q6UE05	265 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PCGF5	Q86SE9	256 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	DPF3	Q92784	378 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CPXM1	Q96SM3	734 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	UNCX	A6NJT0	531 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	FAM159B	A6NKW6	160 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897		F8W8V4	182 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CHAD	O15335	359 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	OAT	P04181	439 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	KRT5	P13647	590 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CRABP2	P29373	138 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CCND2	P30279	289 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	AP3M2	P53677	418 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	INCA1	Q0VD86	236 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	AP1B1	Q10567	949 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NCOA4	Q13772	614 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	DPYSL3	Q14195	570 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ACAP1	Q15027	740 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TTC7B	Q86TV6	843 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PLD5	Q8N7P1	536 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	C7orf31	Q8N865	590 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ACTL9	Q8TC94	416 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CEP170P1	Q96L14	293 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CISH	Q9NSE2	258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897		H0YCG3	227 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897		H0YIN7	160 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	AP1G1	O43747	822 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RAD21	O60216	631 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67

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