RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523263.1

VIRMA-208, Transcript of vir like m6A methyltransferase associated, human

TSL 3

Gene VIRMA, Length 609 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VIRMA-208	ENST00000523263	SPEG	Q15772	3267 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	ZZEF1	O43149	2961 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	LEFTY2	O00292	366 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	HUS1	O60921	280 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	ADAM23	O75077	832 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	GJB3	O75712	270 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	FAM13A	O94988	1023 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	KAT7	O95251	611 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	APOD	P05090	189 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	SYP	P08247	313 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	ITPKA	P23677	461 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	PCSK1	P29120	753 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	CDR1	P51861	262 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	FAM193A	P78312	1265 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	SCAP	Q12770	1279 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	DHCR24	Q15392	516 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	GLRX5	Q86SX6	157 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	CXorf38	Q8TB03	319 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	COL26A1	Q96A83	441 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	HVCN1	Q96D96	273 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	OTUB2	Q96DC9	234 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	AK8	Q96MA6	479 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	ANTXRL	A6NF34	631 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	ZNF217	O75362	1048 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	ADH1C	P00326	375 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	CFI	P05156	583 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	ZNF33A	Q06730	810 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	FRMD1	Q8N878	549 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	STKLD1	Q8NE28	680 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	TSC2	P49815	1807 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	ADSS	P30520	456 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	TIE1	P35590	1138 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	SLC6A11	P48066	632 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	GAD2	Q05329	585 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	MESP2	Q0VG99	397 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	REST	Q13127	1097 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	EMC10	Q5UCC4	262 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	OSTM1	Q86WC4	334 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	GPBP1	Q86WP2	473 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	TTC30A	Q86WT1	665 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	HMGB4	Q8WW32	186 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	C8orf48	Q96LL4	319 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	PLIN2	Q99541	437 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	STRA6	Q9BX79	667 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VIRMA-208	ENST00000523263	RNF38	Q9H0F5	515 aa		10.11	□□□□□ -0.79

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