RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 THP07101 528 aa6.07□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.07□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 UCP3P55916 312 aa6.07□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 WNT3P56703 355 aa6.07□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 NANOGP1Q8N7R0 232 aa6.07□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.07□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa6.07□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.06□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 SOCS2O14508 198 aa6.06□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 INSIG1O15503 277 aa6.06□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 IL1R2P27930 398 aa6.06□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 ADORA2AP29274 412 aa6.06□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 SLC11A2P49281 568 aa6.06□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.06□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.06□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 CPA4Q9UI42 421 aa6.06□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 MROH2BQ7Z745 1585 aa6.06□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 MYMKA6NI61 221 aa6.05□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 FGBP02675 491 aa6.05□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 ALDH2P05091 517 aa6.05□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 FPR3P25089 353 aa6.05□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 E2F1Q01094 437 aa6.05□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 LRRC41Q15345 812 aa6.05□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 CYP1B1Q16678 543 aa6.05□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 ZNF813Q6ZN06 617 aa6.05□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 ZNF280BQ86YH2 543 aa6.05□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.05□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 ABRAQ8N0Z2 381 aa6.05□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 HPS3Q969F9 1004 aa6.05□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 CGRRF1Q99675 332 aa6.05□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 ARMT1Q9H993 441 aa6.05□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 AP4M1O00189 453 aa6.04□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 DSCR3O14972 297 aa6.04□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 SNHG28P0DPA3 235 aa6.04□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 DGKEP52429 567 aa6.04□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 FAM187BQ17R55 369 aa6.04□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.04□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 CUL5Q93034 780 aa6.04□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.04□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.04□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.04□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.04□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 SNX14Q9Y5W7 946 aa6.04□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa6.03□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 TMEM232C9JQI7 657 aa6.03□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 PRKAG1P54619 331 aa6.03□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 RAPGEF1Q13905 1077 aa6.03□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 SHC4Q6S5L8 630 aa6.03□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.03□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 GAS2L3Q86XJ1 694 aa6.03□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 SIRT6Q8N6T7 355 aa6.03□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 PLBD2Q8NHP8 589 aa6.03□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.03□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 RSPRY1Q96DX4 576 aa6.03□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 MRGPRX1Q96LB2 322 aa6.03□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 PRR25Q96S07 402 aa6.03□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 MMS19Q96T76 1030 aa6.03□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 AMFRQ9UKV5 643 aa6.03□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 CECR2Q9BXF3 1484 aa6.02□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 BTBD19C9JJ37 291 aa6.02□□□□□ -1.45
SGCE-211ENST00000522045 FCHO1O14526 889 aa6.02□□□□□ -1.45
SGCE-211ENST00000522045 GCATO75600 419 aa6.02□□□□□ -1.45
SGCE-211ENST00000522045 OFD1O75665 1012 aa6.02□□□□□ -1.45
SGCE-211ENST00000522045 KCNA3P22001 575 aa6.02□□□□□ -1.45
SGCE-211ENST00000522045 RAB1AP62820 205 aa6.02□□□□□ -1.45
SGCE-211ENST00000522045 FGL2Q14314 439 aa6.02□□□□□ -1.45
SGCE-211ENST00000522045 LY6KQ17RY6 165 aa6.02□□□□□ -1.45
SGCE-211ENST00000522045 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.02□□□□□ -1.45
SGCE-211ENST00000522045 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
SGCE-211ENST00000522045 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
SGCE-211ENST00000522045 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.02□□□□□ -1.45
SGCE-211ENST00000522045 SLC15A4Q8N697 577 aa6.02□□□□□ -1.45
SGCE-211ENST00000522045 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa6.02□□□□□ -1.45
SGCE-211ENST00000522045 C16orf52Q8NHV5 167 aa6.02□□□□□ -1.45
SGCE-211ENST00000522045 COQ8BQ96D53 544 aa6.02□□□□□ -1.45
SGCE-211ENST00000522045 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
SGCE-211ENST00000522045 EFHD1Q9BUP0 239 aa6.02□□□□□ -1.45
SGCE-211ENST00000522045 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.02□□□□□ -1.45
SGCE-211ENST00000522045 A0A087WWL8 130 aa6.01□□□□□ -1.45
SGCE-211ENST00000522045 A0A088AWK7 358 aa6.01□□□□□ -1.45
SGCE-211ENST00000522045 PSMD9O00233 223 aa6.01□□□□□ -1.45
SGCE-211ENST00000522045 VNN1O95497 513 aa6.01□□□□□ -1.45
SGCE-211ENST00000522045 CBSLP0DN79 551 aa6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms