RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 SPERTQ8NA61 448 aa8.85□□□□□ -0.99
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TRPS1-209ENST00000519674 COL20A1Q9P218 1284 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-209ENST00000519674 PARP2Q9UGN5 583 aa8.85□□□□□ -0.99
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TRPS1-209ENST00000519674 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
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TRPS1-209ENST00000519674 NLRX1Q86UT6 975 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-209ENST00000519674 NT5DC3Q86UY8 548 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-209ENST00000519674 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-209ENST00000519674 FAM178BQ8IXR5 827 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-209ENST00000519674 JDP2Q8WYK2 163 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-209ENST00000519674 USP6NLQ92738 828 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-209ENST00000519674 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
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