RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP2-220ENST00000511663 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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SH3BP2-220ENST00000511663 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-220ENST00000511663 CPQQ9Y646 472 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-220ENST00000511663 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-220ENST00000511663 GDF9O60383 454 aa20.49■□□□□ 0.87
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SH3BP2-220ENST00000511663 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
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