RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 XPOTO43592 962 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 MALP21145 153 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 ITPKBP27987 946 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 CHRNA5P30532 468 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 RFC4P35249 363 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 MAPK10P53779 464 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 PROK1P58294 105 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 FPGSQ05932 587 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 ITKQ08881 620 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 AKNAD1Q5T1N1 836 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 PPP4R3AQ6IN85 833 aa5.96□□□□□ -1.46
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PDE4D-217ENST00000509355 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
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PDE4D-217ENST00000509355 CCDC151A5D8V7 595 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 WIPF3A6NGB9 483 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 CGB1A6NKQ9 187 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 VWC2LB2RUY7 222 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 GRIA3P42263 894 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 TCF15Q12870 199 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 KAZNQ674X7 775 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 TTC7BQ86TV6 843 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.461e-6■■■□□ 15.4
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PDE4D-217ENST00000509355 PGBD1Q96JS3 809 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 HEPHQ9BQS7 1158 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 IMPG2Q9BZV3 1241 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 IL17RBQ9NRM6 502 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 PASKQ96RG2 1323 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 LY75O60449 1722 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 PKD1L3Q7Z443 1732 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 ADM5C9JUS6 153 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 PIGFQ07326 219 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 GADL1Q6ZQY3 521 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 SLC17A8Q8NDX2 589 aa5.94□□□□□ -1.46
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PDE4D-217ENST00000509355 ASB6Q9NWX5 421 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 ETAA1Q9NY74 926 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 MRFAP1Q9Y605 127 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 KAT6AQ92794 2004 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 C5P01031 1676 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 KAT6BQ8WYB5 2073 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 ALG1L2C9J202 215 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 CA12O43570 354 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 DDNO94850 711 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 GYS1P13807 737 aa5.93□□□□□ -1.46
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PDE4D-217ENST00000509355 CYP2C19P33261 490 aa5.93□□□□□ -1.46
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PDE4D-217ENST00000509355 SH2D3CQ8N5H7 860 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 SNX19Q92543 992 aa5.93□□□□□ -1.46
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PDE4D-217ENST00000509355 CAPNS2Q96L46 248 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 GPR35Q9HC97 309 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 RLIMQ9NVW2 624 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 C4BP0C0L5 1744 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 DOT1LQ8TEK3 1739 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 NFAT5O94916 1531 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
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PDE4D-217ENST00000509355 EPHA10Q5JZY3 1008 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 TAPT1Q6NXT6 567 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 SLC4A10Q6U841 1118 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 GLCCI1Q86VQ1 547 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 IP6K1Q92551 441 aa5.92□□□□□ -1.46
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PDE4D-217ENST00000509355 TRIB1Q96RU8 372 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 CGNL1Q0VF96 1302 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 EVC2Q86UK5 1308 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 RGPD5Q99666 1765 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 PRDX5P30044 214 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 NXPH1P58417 271 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 PTPN21Q16825 1174 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF788Q6ZQV5 615 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-217ENST00000509355 CNTROBQ8N137 903 aa5.91□□□□□ -1.46
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