RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 ABCA7Q8IZY2 2146 aa32.27■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 NUP205Q92621 2012 aa32.26■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP32.26■■■□□ 2.75
ALYREF-202ENST00000505490 BDNFP23560 247 aa32.26■■■□□ 2.75
ALYREF-202ENST00000505490 PMLP29590 882 aa32.26■■■□□ 2.75
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ALYREF-202ENST00000505490 NOP14P78316 857 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
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ALYREF-202ENST00000505490 STPG1Q5TH74 334 aa32.26■■■□□ 2.75
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ALYREF-202ENST00000505490 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
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ALYREF-202ENST00000505490 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa32.25■■■□□ 2.75
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ALYREF-202ENST00000505490 C8orf48Q96LL4 319 aa32.25■■■□□ 2.75
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF840PA6NDX5 716 aa32.24■■■□□ 2.75
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ALYREF-202ENST00000505490 SMOC1Q9H4F8 434 aa32.23■■■□□ 2.75
ALYREF-202ENST00000505490 EHD2Q9NZN4 543 aa32.23■■■□□ 2.75
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ALYREF-202ENST00000505490 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
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ALYREF-202ENST00000505490 ELF2Q15723 593 aa32.21■■■□□ 2.75
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ALYREF-202ENST00000505490 CEP295Q9C0D2 2601 aa32.2■■■□□ 2.75
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ALYREF-202ENST00000505490 CYP27A1Q02318 531 aa32.2■■■□□ 2.75
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ALYREF-202ENST00000505490 F8VP50 259 aa32.19■■■□□ 2.74
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ALYREF-202ENST00000505490 MDH1BQ5I0G3 518 aa32.18■■■□□ 2.74
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ALYREF-202ENST00000505490 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa32.18■■■□□ 2.74
ALYREF-202ENST00000505490 MMP17Q9ULZ9 603 aa32.18■■■□□ 2.74
ALYREF-202ENST00000505490 UBE4BO95155 1302 aa32.18■■■□□ 2.74
ALYREF-202ENST00000505490 STX6O43752 255 aa32.17■■■□□ 2.74
ALYREF-202ENST00000505490 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
ALYREF-202ENST00000505490 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
ALYREF-202ENST00000505490 AMPD3Q01432 767 aa32.17■■■□□ 2.74
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