RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502470.5

MIB2-215, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 5

Gene MIB2, Length 780 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-215	ENST00000502470	WDR44	Q5JSH3	913 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	TAF4B	Q92750	862 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	CHRD	Q9H2X0	955 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	GCNT4	Q9P109	453 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	CFAP54	Q96N23	3096 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	CKM	P06732	381 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	HPS4	Q9NQG7	708 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	RMND1	Q9NWS8	449 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	USP17L7	P0C7H9	530 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	KRT13	P13646	458 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	P4HA1	P13674	534 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	PRCP	P42785	496 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	ASPA	P45381	313 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	ORC1	Q13415	861 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MIB2-215	ENST00000502470	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	ZNF77	Q15935	545 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	TSSK4	Q6SA08	328 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	ACOT1	Q86TX2	421 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	FAM35A	Q86V20	835 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	TNIP3	Q96KP6	325 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	GSDMA	Q96QA5	445 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	EBF3	Q9H4W6	596 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	ARSA	P15289	507 aa		28.81	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	NDST1	P52848	882 aa		28.81	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	ENPEP	Q07075	957 aa		28.81	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	RUNX3	Q13761	415 aa		28.81	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	GAS6	Q14393	721 aa		28.81	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	MTF1	Q14872	753 aa		28.81	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	PON2	Q15165	354 aa		28.81	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	TTC16	Q8NEE8	873 aa		28.81	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	SPATA20	Q8TB22	786 aa		28.81	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	TIGD1	Q96MW7	591 aa		28.81	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	KCNK16	Q96T55	309 aa		28.81	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	MED10	Q9BTT4	135 aa		28.81	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	HDC	P19113	662 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	USP4	Q13107	963 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	FUK	Q8N0W3	1084 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	CHFR	Q96EP1	664 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	EHD2	Q9NZN4	543 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	ATP8B3	O60423	1300 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	SMC2	O95347	1197 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	CCDC130	P13994	396 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	TAF10	Q12962	218 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	SMARCE1	Q969G3	411 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	IER2	Q9BTL4	223 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	CETN3	O15182	167 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	ZXDB	P98169	803 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	LRRC32	Q14392	662 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	UNC93A	Q86WB7	457 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	NUP93	Q8N1F7	819 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	C12orf29	Q8N999	325 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	TWNK	Q96RR1	684 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	PDGFRL	Q15198	375 aa		28.77	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470		Q6ZS52	159 aa		28.77	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		28.77	■■■□□ 2.2
MIB2-215	ENST00000502470	NELL1	Q92832	810 aa		28.77	■■■□□ 2.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms