RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491867.5

ATG4B-222, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-222ENST00000491867 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-222ENST00000491867 SPATA18Q8TC71 538 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-222ENST00000491867 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-222ENST00000491867 MYRFLQ96LU7 910 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-222ENST00000491867 HSPA12BQ96MM6 686 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-222ENST00000491867 PNMA5Q96PV4 448 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-222ENST00000491867 PNKPQ96T60 521 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-222ENST00000491867 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-222ENST00000491867 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-222ENST00000491867 COL6A6A6NMZ7 2263 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-222ENST00000491867 A0A1W2PQD8 194 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 TRABD2BA6NFA1 517 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 TK2O00142 265 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 CBFA2T3O75081 653 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 TCF3P15923 654 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 CYP2F1P24903 491 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 NEK4P51957 841 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 SMTNP53814 917 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 TSPY1Q01534 308 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 ST3GAL1Q11201 340 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 TMEM132DQ14C87 1099 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 SCUBE3Q8IX30 993 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 TRIML1Q8N9V2 468 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 STK24Q9Y6E0 443 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 HELZP42694 1942 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 LEFTY2O00292 366 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 OGTO15294 1046 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 PLS3P13797 630 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 GABRG2P18507 467 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 ZXDBP98169 803 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 KDSRQ06136 332 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 RESTQ13127 1097 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 DHCR24Q15392 516 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF605Q86T29 641 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 C12orf40Q86WS4 652 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 ARHGEF4Q9NR80 690 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 NEFLP07196 543 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 GUCY2CP25092 1073 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 GRIA2P42262 883 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 TNFRSF4P43489 277 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 ABCG1P45844 678 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 TAF6P49848 677 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 LIG4P49917 911 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 GUCY1B3Q02153 619 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 GRIK2Q13002 908 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 KCNK18Q7Z418 384 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 CD302Q8IX05 232 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 RGL4Q8IZJ4 473 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 FSIP1Q8NA03 581 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 ABCB6Q9NP58 842 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 KCNG1Q9UIX4 513 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 RAI2Q9Y5P3 530 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 A0A0A0MRY4 1105 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 RHBDF2Q6PJF5 856 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF843Q8N446 348 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 TIPINQ9BVW5 301 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 CCSER1Q9C0I3 900 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 CYP8B1Q9UNU6 501 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 DERAQ9Y315 318 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 MYH11P35749 1972 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 A0A0B4J269 797 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 PP2D1A8MPX8 630 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 KPNA7A9QM74 516 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 GNSP15586 552 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 CDC25AP30304 524 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 PDE6CP51160 858 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 PDIA5Q14554 519 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 CCDC142Q17RM4 750 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 TTC38Q5R3I4 469 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 SYCP2LQ5T4T6 812 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 C4orf32Q8N8J7 132 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-222ENST00000491867 C8orf76Q96K31 380 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms