RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	COPA	P53621	1224 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	ROR1	Q01973	937 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	MSS51	Q4VC12	460 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	NPNT	Q6UXI9	565 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	PGBD4	Q96DM1	585 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	LZTS1	Q9Y250	596 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	ALOX15B	O15296	676 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	TBC1D12	O60347	775 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	SNHG28	P0DPA3	235 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	AQP4	P55087	323 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	GDF10	P55107	478 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	DCLK2	Q8N568	766 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	SCYL1	Q96KG9	808 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	EBF4	Q9BQW3	602 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	DMAC2	Q9NW81	257 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	MYH11	P35749	1972 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	TM9SF1	O15321	606 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	PML	P29590	882 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	INHBE	P58166	350 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	PDK3	Q15120	406 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	WDR78	Q5VTH9	848 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	DAW1	Q8N136	415 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	LMO3	Q8TAP4	145 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	KRT82	Q9NSB4	513 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	NYAP2	Q9P242	653 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	UBE4B	O95155	1302 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	MX2	P20592	715 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	IL31	Q6EBC2	164 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	TREML1	Q86YW5	311 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	CERS5	Q8N5B7	392 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	ALLC	Q8N6M5	410 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	APOPT1	Q96IL0	206 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	OCEL1	Q9H607	264 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	ADA2	Q9NZK5	511 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	USP21	Q9UK80	565 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	SOX13	Q9UN79	622 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292		A8MXQ7	604 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	DCX	O43602	365 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	BBOX1	O75936	387 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	NUDT2	P50583	147 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	ART3	Q13508	389 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	HPS6	Q86YV9	775 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	HACE1	Q8IYU2	909 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	NENF	Q9UMX5	172 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	ABLIM1	O14639	778 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	ABCG1	P45844	678 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	PKNOX1	P55347	436 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	GPX6	P59796	221 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	CYP24A1	Q07973	514 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	DLG1	Q12959	904 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	RMDN3	Q96TC7	470 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
ERCC3-208	ENST00000491292	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		10.23	□□□□□ -0.77

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