RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.3■■□□□ 1.16
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NELFE-210ENST00000491139 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
NELFE-210ENST00000491139 KRT19P08727 400 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-210ENST00000491139 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
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NELFE-210ENST00000491139 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
NELFE-210ENST00000491139 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.29■■□□□ 1.16
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NELFE-210ENST00000491139 SPATA17Q96L03 361 aa22.28■■□□□ 1.16
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NELFE-210ENST00000491139 TMEM74BQ9NUR3 256 aa22.28■■□□□ 1.16
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NELFE-210ENST00000491139 BMP15O95972 392 aa22.26■■□□□ 1.15
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NELFE-210ENST00000491139 SLC6A11P48066 632 aa22.26■■□□□ 1.15
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NELFE-210ENST00000491139 EHD2Q9NZN4 543 aa22.26■■□□□ 1.15
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NELFE-210ENST00000491139 LHX6Q9UPM6 363 aa22.26■■□□□ 1.15
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NELFE-210ENST00000491139 UPK3BL2E5RIL1 263 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-210ENST00000491139 BDNFP23560 247 aa22.25■■□□□ 1.15
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NELFE-210ENST00000491139 PPP3CCP48454 512 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-210ENST00000491139 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NELFE-210ENST00000491139 USP46P62068 366 aa22.25■■□□□ 1.15
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