RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 TCF25Q9BQ70 676 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 CLSTN3Q9BQT9 956 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 DUSP16Q9BY84 665 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 DPEP3Q9H4B8 488 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 TSPAN16Q9UKR8 245 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 NME7Q9Y5B8 376 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 CDY1Q9Y6F8 540 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 TSC2P49815 1807 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 KIAA1671Q9BY89 1806 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 TMEM221A6NGB7 291 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 M0R296 226 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 TRIM66O15016 1216 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 RTN2O75298 545 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 MICAL2O94851 1124 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 NDUFA10O95299 355 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 MMEP08473 750 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 FAM200BP0CF97 657 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 ATF2P15336 505 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 CHRNB2P17787 502 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 OR1D2P34982 312 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 ACADSBP45954 432 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 KIF11P52732 1056 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 ROR1Q01973 937 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 CYP27A1Q02318 531 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 SLC39A12Q504Y0 691 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 PKDCCQ504Y2 493 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 TRIM67Q6ZTA4 783 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 FAM35AQ86V20 835 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 FUKQ8N0W3 1084 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 C12orf29Q8N999 325 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 SLC2A14Q8TDB8 520 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 MYLPFQ96A32 169 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 HSFY1Q96LI6 401 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 CHP1Q99653 195 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 MED10Q9BTT4 135 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 B3GNT5Q9BYG0 378 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 ISCUQ9H1K1 167 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 FAM86C1Q9NVL1 165 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 COMMD8Q9NX08 183 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 EHD2Q9NZN4 543 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 INTUQ9ULD6 942 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 CACNA1HO95180 2353 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 MTMR11A4FU01 709 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 C2orf71A6NGG8 1288 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 M0QYV0 167 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 C2CD2LO14523 706 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 ATP2C2O75185 946 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 MYBL1P10243 752 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 UNGP13051 313 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 NPR3P17342 541 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 ELF1P32519 619 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 GPD2P43304 727 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 NSFP46459 744 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 PLA2G4AP47712 749 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 ERVFC1P60507 584 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 CCZ1BP86790 482 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 CENPCQ03188 943 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 GOLGA8FQ08AF8 430 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 PLD1Q13393 1074 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 ADAM15Q13444 863 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 ACAD10Q6JQN1 1059 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 CCDC149Q6ZUS6 474 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 LRRTM3Q86VH5 581 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 GLYCTKQ8IVS8 523 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 TCEAL8Q8IYN2 117 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 SLC20A1Q8WUM9 679 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 SLC35F5Q8WV83 523 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 KCTD13Q8WZ19 329 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 B3GALT6Q96L58 329 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 C8orf48Q96LL4 319 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 KLHL5Q96PQ7 755 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 ZSWIM1Q9BR11 485 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 FAM49BQ9NUQ9 324 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 NAGPAQ9UK23 515 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 STRIP2Q9ULQ0 834 aa12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms