RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484918.1

MRPL23-209, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, human

TSL 5

Gene MRPL23, Length 232 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL23-209	ENST00000484918	CUL5	Q93034	780 aa		6.93	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	CPB2	Q96IY4	423 aa		6.93	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	C5orf34	Q96MH7	638 aa		6.93	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		6.93	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		6.93	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	DLL4	Q9NR61	685 aa		6.93	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		6.93	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		6.93	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	RP1	P56715	2156 aa		6.93	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	ABCA4	P78363	2273 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918		H7C4K7	107 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918		K7EM74	188 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	MARCH6	O60337	910 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	NFATC1	O95644	943 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	IGLV3-19	P01714	112 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	CYP17A1	P05093	508 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	TH	P07101	528 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	NR1D1	P20393	614 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	AXL	P30530	894 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	GRIA2	P42262	883 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	CLCNKB	P51801	687 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	PRKCE	Q02156	737 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	DUSP4	Q13115	394 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	ORC1	Q13415	861 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	NOTUM	Q6P988	496 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	ACOX2	Q99424	681 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	GABRG3	Q99928	467 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	KAT14	Q9H8E8	782 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918		A0A1B0GVM2	712 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	MYMK	A6NI61	221 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	TRIM38	O00635	465 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	SYN3	O14994	580 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	VILL	O15195	856 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	YKT6	O15498	198 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	GRID2	O43424	1007 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	TRAPPC3	O43617	180 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	SOAT2	O75908	522 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	SMARCA1	P28370	1054 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	DNM2	P50570	870 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	TPMT	P51580	245 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	KDSR	Q06136	332 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	UGCG	Q16739	394 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	UPP1	Q16831	310 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	TXNDC8	Q6A555	127 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	HACE1	Q8IYU2	909 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	TEX19	Q8NA77	164 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	SNX19	Q92543	992 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	RAD54B	Q9Y620	910 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	TMEM150B	A6NC51	233 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	TTLL8	A6PVC2	850 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	SIGLEC6	O43699	453 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	STBD1	O95210	358 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	F11	P03951	625 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	PSAP	P07602	524 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	CPB1	P15086	417 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	FECH	P22830	423 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	ALDH1A3	P47895	512 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	AMHR2	Q16671	573 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	CEP55	Q53EZ4	464 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	CENPP	Q6IPU0	288 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF280D	Q6N043	979 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	ITIH5	Q86UX2	942 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF276	Q8N554	614 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	ARSG	Q96EG1	525 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	GCNA	Q96QF7	691 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MRPL23-209	ENST00000484918	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		6.9	□□□□□ -1.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms