RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484454.1

TARBP1-208, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene TARBP1, Length 426 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP1-208	ENST00000484454	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	RAB30	Q15771	203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	ICE2	Q659A1	982 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	SPRED1	Q7Z699	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	SSH3	Q8TE77	659 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	ASB10	Q8WXI3	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	SNX27	Q96L92	541 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	HPSE	Q9Y251	543 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARBP1-208	ENST00000484454	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	KCNQ3	O43525	872 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	VNN1	O95497	513 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	RHO	P08100	348 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	ITGAM	P11215	1152 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	NTSR1	P30989	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	LY6K	Q17RY6	165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	SYNE4	Q8N205	404 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	NELL2	Q99435	816 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	AGPS	O00116	658 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	NPC1	O15118	1278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	EGR1	P18146	543 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	YY1	P25490	414 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	PDE6C	P51160	858 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	FOXE3	Q13461	319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	BLMH	Q13867	455 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	ZACN	Q401N2	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	HAS1	Q92839	578 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARBP1-208	ENST00000484454	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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