RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484101.5

UFD1-208, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, human

TSL 5

Gene UFD1, Length 751 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UFD1-208	ENST00000484101	PTK7	Q13308	1070 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TFDP2	Q14188	446 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PDK2	Q15119	407 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	DENND2C	Q68D51	928 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	AADACL2	Q6P093	401 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TMEM110	Q86TL2	294 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	RELL1	Q8IUW5	271 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TRPV1	Q8NER1	839 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	CCDC114	Q96M63	670 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	RSAD1	Q9HA92	442 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ST7	Q9NRC1	585 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PLAA	Q9Y263	795 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ALPK3	Q96L96	1907 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101		A8MXQ7	604 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101		F8VP50	259 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	LIAS	O43766	372 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF623	O75123	536 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	LRCH4	O75427	683 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ATP5D	P30049	168 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PTPN9	P43378	593 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	LHX1	P48742	406 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PLTP	P55058	493 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SKOR1	P84550	965 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SLC6A3	Q01959	620 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ADCY2	Q08462	1091 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	MGAT3	Q09327	533 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	HIC1	Q14526	733 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	BOLA3	Q53S33	107 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	C2CD6	Q53TS8	623 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	BBS12	Q6ZW61	710 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PCGF5	Q86SE9	256 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	RNF180	Q86T96	592 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TDH	Q8IZJ6	230 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PGBD4	Q96DM1	585 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	UROC1	Q96N76	676 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PPCS	Q9HAB8	311 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TMEM51	Q9NW97	253 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SNX24	Q9Y343	169 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101		E5RJQ4	531 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	MDM4	O15151	490 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PRPSAP2	O60256	369 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TH	P07101	528 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	IVL	P07476	585 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SDC4	P31431	198 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	GJC1	P36383	396 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PRMT2	P55345	433 aa		10.1	□□□□□ -0.79

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