RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480155.1

SHOC2-204, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, human

TSL 2

Gene SHOC2, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHOC2-204	ENST00000480155	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	PHKB	Q93100	1093 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155		H0YIZ8	118 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	MASP2	O00187	686 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	TRIM27	P14373	513 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	ENG	P17813	658 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	DRD4	P21917	467 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	ITPKB	P27987	946 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	CCT8	P50990	548 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	TBX4	P57082	545 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	TBCB	Q99426	244 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	POM121B	A6NF01	834 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	PRC1	O43663	620 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	RGS10	O43665	173 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	ORC4	O43929	436 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	NXPH3	O95157	252 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	MT-ND5	P03915	603 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	HGF	P14210	728 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	NDUFB7	P17568	137 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	ACVR2A	P27037	513 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	CYP2C18	P33260	490 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	PRIM2	P49643	509 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	PDE1A	P54750	535 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	NPY5R	Q15761	445 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	SNX22	Q96L94	193 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	UROC1	Q96N76	676 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	AGPS	O00116	658 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	PIAS2	O75928	621 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	TSHR	P16473	764 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	CTGF	P29279	349 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	CPT1A	P50416	773 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	CASP5	P51878	434 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	NEK3	P51956	506 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	STK3	Q13188	491 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	DAG1	Q14118	895 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SHOC2-204	ENST00000480155	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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