RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472863.5

HOXB3-207, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-207ENST00000472863 F8VP50 259 aa28.94■■■□□ 2.22
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HOXB3-207ENST00000472863 CTIFO43310 598 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
HOXB3-207ENST00000472863 EFCAB14O75071 495 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXB3-207ENST00000472863 AP1G2O75843 785 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXB3-207ENST00000472863 OR4Q2P0C623 313 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXB3-207ENST00000472863 SLC1A1P43005 524 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXB3-207ENST00000472863 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
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HOXB3-207ENST00000472863 SLC8A3P57103 927 aa28.94■■■□□ 2.22
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HOXB3-207ENST00000472863 CLEC4CQ8WTT0 213 aa28.94■■■□□ 2.22
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HOXB3-207ENST00000472863 GRAP2O75791 330 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXB3-207ENST00000472863 TSPY1Q01534 308 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXB3-207ENST00000472863 TAS1R1Q7RTX1 841 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXB3-207ENST00000472863 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP28.94■■■□□ 2.227e-8■■■■■ 58.7
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HOXB3-207ENST00000472863 ZMIZ2Q8NF64 920 aa28.93■■■□□ 2.22
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HOXB3-207ENST00000472863 CTAGE4Q8IX94 777 aa28.92■■■□□ 2.22
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HOXB3-207ENST00000472863 ACADSBP45954 432 aa28.92■■■□□ 2.22
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HOXB3-207ENST00000472863 IGSF21Q96ID5 467 aa28.88■■■□□ 2.21
HOXB3-207ENST00000472863 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
HOXB3-207ENST00000472863 HHLA1C9JL84 531 aa28.88■■■□□ 2.21
HOXB3-207ENST00000472863 PYGMP11217 842 aa28.88■■■□□ 2.21
HOXB3-207ENST00000472863 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
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