RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 PDE1AP54750 535 aa8.28□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa8.28□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 UNC13DQ70J99 1090 aa8.28□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 ABRAQ8N0Z2 381 aa8.28□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 XAGE5Q8WWM1 108 aa8.28□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 BTBD1Q9H0C5 482 aa8.28□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 SEMA4GQ9NTN9 838 aa8.28□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 MID2Q9UJV3 735 aa8.28□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 ADAM21Q9UKJ8 722 aa8.28□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 LRRC3CA6NJW4 275 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 RHPN2P1A8MT19 583 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 RAB27BO00194 218 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 SRGAP2O75044 1071 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 RASAL1O95294 804 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 NDUFB7P17568 137 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 DRD4P21917 467 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 ITPKBP27987 946 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 PIK3CBP42338 1070 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 SLC9A4Q6AI14 798 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 KSR2Q6VAB6 950 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 SPARTQ8N0X7 666 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 KRT78Q8N1N4 520 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 LRRC71Q8N4P6 559 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 PHKBQ93100 1093 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 KPNA5O15131 536 aa8.26□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 TXNP10599 105 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 SLC5A1P13866 664 aa8.26□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 CYP2C18P33260 490 aa8.26□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 FAM153CQ494X1 144 aa8.26□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 PRIMA1Q86XR5 153 aa8.26□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 IZUMO1Q8IYV9 350 aa8.26□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 MSLNLQ96KJ4 702 aa8.26□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 TIMP4Q99727 224 aa8.26□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 C17orf80Q9BSJ5 609 aa8.26□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.26□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 H0YIZ8 118 aa8.25□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 PMM2O15305 246 aa8.25□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 RGS10O43665 173 aa8.25□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 RRP9O43818 475 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 TRIM27P14373 513 aa8.25□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 ENGP17813 658 aa8.25□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 CARSP49589 748 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 ARHGEF7Q14155 803 aa8.25□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 INSCQ1MX18 579 aa8.25□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 CCDC136Q96JN2 1154 aa8.25□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 PPFIA2O75334 1257 aa8.24□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 MT-ND5P03915 603 aa8.24□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 ACVR2AP27037 513 aa8.24□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 SLC29A2Q14542 456 aa8.24□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 NPY5RQ15761 445 aa8.24□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 CERCAMQ5T4B2 595 aa8.24□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 FCRL6Q6DN72 434 aa8.24□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa8.24□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 LIX1LQ8IVB5 337 aa8.24□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 SOCS4Q8WXH5 440 aa8.24□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 SNX22Q96L94 193 aa8.24□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 AS3MTQ9HBK9 375 aa8.24□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 TBC1D23Q9NUY8 699 aa8.24□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 QSOX1O00391 747 aa8.23□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 CCP110O43303 1012 aa8.23□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 ONECUT2O95948 504 aa8.23□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 MYL3P08590 195 aa8.23□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 FAM163BP0C2L3 166 aa8.23□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 RPL17P18621 184 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 GPD1P21695 349 aa8.23□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 ELLP55199 621 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 STK3Q13188 491 aa8.23□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa8.23□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 YAF2Q8IY57 180 aa8.23□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 ZNF384Q8TF68 577 aa8.23□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 SARAFQ96BY9 339 aa8.23□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 TBCBQ99426 244 aa8.23□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 PNPLA8Q9NP80 782 aa8.23□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 DUSP22Q9NRW4 184 aa8.23□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 SH2B3Q9UQQ2 575 aa8.23□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 PIAS2O75928 621 aa8.22□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 HGFP14210 728 aa8.22□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 CPT1AP50416 773 aa8.22□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 ZNF543Q08ER8 600 aa8.22□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 CCNIQ14094 377 aa8.22□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 DAG1Q14118 895 aa8.22□□□□□ -1.09
SGCE-210ENST00000472326 KCNAB1Q14722 419 aa8.22□□□□□ -1.09
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