RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465634.5

TRIM5-208, Transcript of tripartite motif containing 5, human

TSL 1 (best)

Gene TRIM5, Length 602 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM5-208	ENST00000465634	TMEM139	Q8IV31	216 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	SCML4	Q8N228	414 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	EFHB	Q8N7U6	833 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	UBA3	Q8TBC4	463 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	LRCH3	Q96II8	777 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	ISCU	Q9H1K1	167 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	IL37	Q9NZH6	218 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	NAGPA	Q9UK23	515 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	HHLA1	C9JL84	531 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634		F8VP50	259 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	PER2	O15055	1255 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	ZMYND10	O75800	440 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	FBXO21	O94952	628 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	NDUFA10	O95299	355 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	SEC24A	O95486	1093 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	C8A	P07357	584 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	CFH	P08603	1231 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	CSH1	P0DML2	217 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	CSH2	P0DML3	217 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	MMP8	P22894	467 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	GABRB2	P47870	512 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	NRIP1	P48552	1158 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	KIF11	P52732	1056 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	EPHB3	P54753	998 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	KRT83	P78385	493 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	PDCL	Q13371	301 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	VEPH1	Q14D04	833 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	SPA17	Q15506	151 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	CCDC142	Q17RM4	750 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	RAB41	Q5JT25	222 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	PMF1	Q6P1K2	205 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	PIGZ	Q86VD9	579 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	ERICH1	Q86X53	443 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	NUP93	Q8N1F7	819 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	ELMOD1	Q8N336	334 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	CASP10	Q92851	521 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	TRIM11	Q96F44	468 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	KCNK16	Q96T55	309 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	INTU	Q9ULD6	942 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	YIPF1	Q9Y548	306 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	FAM92A	A1XBS5	289 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	ANKRD62	A6NC57	917 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	TNFRSF10B	O14763	440 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	XYLB	O75191	536 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	BEST1	O76090	585 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	LRG1	P02750	347 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	CALB1	P05937	261 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	MYBL1	P10243	752 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	SCNN1A	P37088	669 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	PPP3CC	P48454	512 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	CACNA2D1	P54289	1103 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	HYAL1	Q12794	435 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	DDR2	Q16832	855 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	HS1BP3	Q53T59	392 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	NAA35	Q5VZE5	725 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TRIM5-208	ENST00000465634	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		10.17	□□□□□ -0.78

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