RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 CDKN2BP42772 138 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ZACNQ401N2 412 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SPOPLQ6IQ16 392 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM270Q6UE05 265 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TMPRSS6Q8IU80 811 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PALM2Q8IXS6 379 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGAP18Q8N392 663 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 WRNIP1Q96S55 665 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC28BQ9BUN5 200 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 NMUR2Q9GZQ4 415 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PSME4Q14997 1843 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 C2orf71A6NGG8 1288 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CLDN10P78369 228 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CUL2Q13617 745 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TTC17Q96AE7 1141 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 FAM111AQ96PZ2 611 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 VPS33BQ9H267 617 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 KCNG1Q9UIX4 513 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 STRIP2Q9ULQ0 834 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 B2RBV5 119 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ANPEPP15144 967 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 BACE1P56817 501 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GHRHRQ02643 423 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SLC18A2Q05940 514 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PRKG1Q13976 671 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 VSIG10LQ86VR7 867 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 AZIN2Q96A70 460 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PICK1Q9NRD5 415 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CNTN3Q9P232 1028 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ARMCX1Q9P291 453 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 KLF11O14901 512 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 MMP8P22894 467 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 DSG1Q02413 1049 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SAMD3Q8N6K7 520 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CYTH2Q99418 400 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 DNAJB4Q9UDY4 337 aa15.61■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 F8VP50 259 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 NFKBIEO00221 500 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CPA2P48052 419 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PTK7Q13308 1070 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 LAMB3Q13751 1172 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 C6orf163Q5TEZ5 329 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 IZUMO2Q6UXV1 221 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SMC1BQ8NDV3 1235 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SERAC1Q96JX3 654 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 FNBP1Q96RU3 617 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GINM1Q9NU53 330 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PCMTD2Q9NV79 361 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 KCNK4Q9NYG8 393 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CAPN14A8MX76 684 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 H3BRJ5 948 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CIB2O75838 187 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TNNI1P19237 187 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PSMD6Q15008 389 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 BBS9Q3SYG4 887 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 RFX8Q6ZV50 586 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SH2D5Q6ZV89 423 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SCUBE1Q8IWY4 988 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PDIK1LQ8N165 341 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF280CQ8ND82 737 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 MCEEQ96PE7 176 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 C17orf75Q9HAS0 396 aa15.6■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 EXTL3O43909 919 aa15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GSTT1P30711 240 aa15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GDF10P55107 478 aa15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 MTERF2Q49AM1 385 aa15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ECSITQ9BQ95 431 aa15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 NDE1Q9NXR1 346 aa15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CNTN6Q9UQ52 1028 aa15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 IKBKGQ9Y6K9 419 aa15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TM7SF2O76062 418 aa15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 VNN1O95497 513 aa15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CALB1P05937 261 aa15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CRABP2P29373 138 aa15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 RPL22P35268 128 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms