RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429160.1

UBXN7-205, Transcript of UBX domain protein 7, human

TSL 2

Gene UBXN7, Length 3,158 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN7-205	ENST00000429160	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	KXD1	Q9BQD3	176 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM92A	A1XBS5	289 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	CDH8	P55286	799 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	CISH	Q9NSE2	258 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	AP1G2	O75843	785 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	YWHAQ	P27348	245 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	AVPR1A	P37288	418 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	KCNH2	Q12809	1159 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	PDGFRL	Q15198	375 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	VIT	Q6UXI7	678 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ACOT1	Q86TX2	421 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ANO10	Q9NW15	660 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	NCAM2	O15394	837 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	VDR	P11473	427 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	GPR15	P49685	360 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	PSEN1	P49768	467 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	USP4	Q13107	963 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	FUK	Q8N0W3	1084 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	WHAMM	Q8TF30	809 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	KRT82	Q9NSB4	513 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		11.66	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	HCRT	O43612	131 aa		11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	AOC1	P19801	751 aa		11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	RFX1	P22670	979 aa		11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC7A9	P82251	487 aa		11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	AMPD2	Q01433	879 aa		11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	MAN2A1	Q16706	1144 aa		11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	SCML4	Q8N228	414 aa		11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	DUSP16	Q9BY84	665 aa		11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	BRD9	Q9H8M2	597 aa		11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160		F8VP50	259 aa		11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	TPM2	P07951	284 aa		11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	STX17	P56962	302 aa		11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	STX1A	Q16623	288 aa		11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	GBP6	Q6ZN66	633 aa		11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	GPR152	Q8TDT2	470 aa		11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	GCNT4	Q9P109	453 aa		11.65	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	TNFRSF10B	O14763	440 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	TADA3	O75528	432 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	OLFM2	O95897	454 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	PTPN5	P54829	565 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	CYP4F8	P98187	520 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	SGO2	Q562F6	1265 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	SIX5	Q8N196	739 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	GPT2	Q8TD30	523 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	TDP1	Q9NUW8	608 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	SCML2	Q9UQR0	700 aa		11.65	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	CFH	P08603	1231 aa		11.64	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		11.64	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	SETSIP	P0DME0	302 aa		11.64	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	NPR3	P17342	541 aa		11.64	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	AVPR2	P30518	371 aa		11.64	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	RAD23B	P54727	409 aa		11.64	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		11.64	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	LMO3	Q8TAP4	145 aa		11.64	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	FBXO32	Q969P5	355 aa		11.64	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	COL9A1	P20849	921 aa		11.64	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	BCAT1	P54687	386 aa		11.64	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	MFAP3	P55082	362 aa		11.64	□□□□□ -0.55
UBXN7-205	ENST00000429160	GPC5	P78333	572 aa		11.64	□□□□□ -0.55

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