RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428963.6

CENPN-204, Transcript of centromere protein N, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CENPN, Length 971 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPN-204ENST00000428963 ACAP3Q96P50 834 aa8.06□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 HAPLN2Q9GZV7 340 aa8.06□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 RNF112Q9ULX5 631 aa8.06□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.06□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 MTMR11A4FU01 709 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 ANTXRLA6NF34 631 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 CCDC169A6NNP5 214 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 M0QZQ0 153 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 REC8O95072 547 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 EGFP01133 1207 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 RPL9P32969 192 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 NPTX2P47972 431 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 EFNA5P52803 228 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 YARSP54577 528 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 SEC13P55735 322 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 GUCY1B3Q02153 619 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 ST3GAL1Q11201 340 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 MAPK7Q13164 816 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 PPP2R5AQ15172 486 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 ME3Q16798 604 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 PLK5Q496M5 336 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 GPR158Q5T848 1215 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 TRIM68Q6AZZ1 485 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 CENPPQ6IPU0 288 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 C4orf32Q8N8J7 132 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 ATAD1Q8NBU5 361 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 E2F7Q96AV8 911 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 MSANTD3Q96H12 275 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 IFT74Q96LB3 600 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 BHMT2Q9H2M3 363 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 HPS4Q9NQG7 708 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 SLC38A7Q9NVC3 462 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 CITO14578 2027 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 NBEAQ8NFP9 2946 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 SPAG17Q6Q759 2223 aa8.05□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 ATRXP46100 2492 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 E9PMD0 336 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 HIP1RO75146 1068 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 OAZ2O95190 189 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 CXCL8P10145 99 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 MCF2P10911 925 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.129e-7■■□□□ 11.6
CENPN-204ENST00000428963 GABRR2P28476 465 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 MPLP40238 635 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 TNFSF9P41273 254 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 TMEM196Q5HYL7 178 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 RNF43Q68DV7 783 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 KCNK18Q7Z418 384 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 LEMD2Q8NC56 503 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 APPL2Q8NEU8 664 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 BPIFB1Q8TDL5 484 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 TTC9Q92623 222 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 KIFAP3Q92845 792 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 LOXL4Q96JB6 756 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 HHIPQ96QV1 700 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 SLC46A2Q9BY10 475 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 GPR88Q9GZN0 384 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 GKN1Q9NS71 199 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 MAFFQ9ULX9 164 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 CCL26Q9Y258 94 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 INVSQ9Y283 1065 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa8.04□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa8.03□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 FAM208BQ5VWN6 2430 aa8.03□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 C4orf47A7E2U8 309 aa8.03□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 SLC16A4O15374 487 aa8.03□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 OR52Z1P0C646 297 aa8.03□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 CCDC192P0DO97 292 aa8.03□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 ARSAP15289 507 aa8.03□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 NOS3P29474 1203 aa8.03□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 LRPAP1P30533 357 aa8.03□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 GALK1P51570 392 aa8.03□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 EPHB3P54753 998 aa8.03□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 GPR17Q13304 367 aa8.03□□□□□ -1.12
CENPN-204ENST00000428963 ZBTB6Q15916 424 aa8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms