RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KCNK16Q96T55 309 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LHX5Q9H2C1 402 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GRPEL1Q9HAV7 217 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HESX1Q9UBX0 185 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CD207Q9UJ71 328 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SCN1AP35498 2009 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 VWA8A3KMH1 1905 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM92AA1XBS5 289 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC38A8A6NNN8 435 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HHLA1C9JL84 531 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 M0QYV0 167 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 THAP12O43422 761 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MFAP3LO75121 409 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MICAL2O94851 1124 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADCY5O95622 1261 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FGF19O95750 216 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LSM8O95777 96 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CALCAP01258 141 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TPM1P09493 284 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CSH1P0DML2 217 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CSH2P0DML3 217 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KCNA5P22460 613 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANXA13P27216 316 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CASP14P31944 242 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRKCIP41743 596 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GPD2P43304 727 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PLA2G4AP47712 749 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RPL34P49207 117 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GPR15P49685 360 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CDR1P51861 262 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC5A3P53794 718 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LEXMQ3ZCV2 418 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CES5AQ6NT32 575 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DENND1BQ6P3S1 775 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMC5Q6UXY8 1006 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMC8Q8IU68 726 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SCN4BQ8IWT1 228 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DRC7Q8IY82 874 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OLIG1Q8TAK6 271 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC35F5Q8WV83 523 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPM1EQ8WY54 764 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SUSD6Q92537 303 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NECTIN4Q96NY8 510 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DNAJC7Q99615 494 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SYT11Q9BT88 431 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TTLL2Q9BWV7 592 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LRRC3Q9BY71 257 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COMMD8Q9NX08 183 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IL37Q9NZH6 218 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EHD2Q9NZN4 543 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SZT2Q5T011 3432 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRIP11Q15643 1979 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NCANO14594 1321 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 H3BQ06 376 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCL16O15467 120 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CFHP08603 1231 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PTPN2P17706 415 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CHRNB2P17787 502 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRT9P35527 623 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAP3K7CLP57077 242 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FMO1Q01740 532 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ASIC2Q16515 512 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAB41Q5JT25 222 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ATAT1Q5SQI0 421 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SDHAF4Q5VUM1 108 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRIM72Q6ZMU5 477 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EP400NLQ6ZTU2 488 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMC6Q7Z403 805 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PIGZQ86VD9 579 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CNGA4Q8IV77 575 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NUP93Q8N1F7 819 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SCML4Q8N228 414 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ELMOD1Q8N336 334 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR8K1Q8NGG5 319 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 UBA3Q8TBC4 463 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FEZF2Q8TBJ5 459 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GPR152Q8TDT2 470 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CPLX3Q8WVH0 158 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HSFY1Q96LI6 401 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RIPOR3Q96MK2 946 aa8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms