RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DPP3Q9NY33 737 aa15.47■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NDUFA13Q9P0J0 144 aa15.47■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RPS6P62753 249 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PGK2P07205 417 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CTSHP09668 335 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SCUBE1Q8IWY4 988 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C10orf88Q9H8K7 445 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TIMM44O43615 452 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CALB2P22676 271 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BTKQ06187 659 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC142Q17RM4 750 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LRRC71Q8N4P6 559 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WWOXQ9NZC7 414 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TAGLN3Q9UI15 199 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HAO1Q9UJM8 370 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC15Q0P6D6 951 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SGO1Q5FBB7 561 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IYDQ6PHW0 289 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 APBB2Q92870 758 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CAVIN3Q969G5 261 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TADA1Q96BN2 335 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 V9GYQ6 96 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IQSEC2Q5JU85 1478 aa15.46■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC2A3P11169 496 aa15.46■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AVPR1AP37288 418 aa15.46■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMED10P49755 219 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MMP14P50281 582 aa15.46■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM245Q9H330 911 aa15.46■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPON1Q9HCB6 807 aa15.46■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SERPINB5P36952 375 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHSY1Q86X52 802 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF786Q8N393 782 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AGBL3Q8NEM8 1001 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RMND5AQ9H871 391 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RNF112Q9ULX5 631 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A087X0T9 212 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GRIN3BO60391 1043 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM228BP0C875 321 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CYP2C9P11712 490 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ODC1P11926 461 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PSMD7P51665 324 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LRRC6Q86X45 466 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EFCAB1Q9HAE3 211 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SDR42E2A6NKP2 422 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TM9SF1O15321 606 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRT75O95678 551 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NCALDP61601 193 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM62Q0P6H9 643 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MGAT5BQ3V5L5 792 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HOMEZQ8IX15 550 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LMTK2Q8IWU2 1503 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MICU2Q8IYU8 434 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ATP8B4Q8TF62 1192 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AGBL1Q96MI9 1066 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BRD8Q9H0E9 1235 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A0G2JLW4 131 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MTM1Q13496 603 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TTLL9Q3SXZ7 439 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZCWPW2Q504Y3 356 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MRNIPQ6NTE8 343 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC81Q6ZN84 652 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LUZP2Q86TE4 346 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CRLS1Q9UJA2 301 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TAF6LQ9Y6J9 622 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRRG1O14668 218 aa15.44■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VDRP11473 427 aa15.44■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CYP11B1P15538 503 aa15.44■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MAPK1P28482 360 aa15.44■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WDCPQ9H6R7 721 aa15.44■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYOZ2Q9NPC6 264 aa15.44■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIAA1257Q9ULG3 409 aa15.44■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HPSEQ9Y251 543 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.6 ms