RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 SLC7A14Q8TBB6 771 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 MAN1C1Q9NR34 630 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 TULP2O00295 520 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 KIF11P52732 1056 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 NOMO3P69849 1222 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 ADGRE1Q14246 886 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 DDR2Q16832 855 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC149Q6ZUS6 474 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 ZMIZ2Q8NF64 920 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 SLC22A17Q8WUG5 538 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 CPA5Q8WXQ8 436 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 NOX5Q96PH1 765 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 IGFLR1Q9H665 355 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 ST7Q9NRC1 585 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 YIPF1Q9Y548 306 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 INSL5Q9Y5Q6 135 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 MTCH2Q9Y6C9 303 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 A0A087X0T9 212 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 TMCO5BA8MYB1 307 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 C1RP00736 705 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 C8AP07357 584 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 FAM228BP0C875 321 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 RGS7P49802 495 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 PIGZQ86VD9 579 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 SLC30A5Q8TAD4 765 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 SLC35F5Q8WV83 523 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 C8orf48Q96LL4 319 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 NSFP46459 744 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 PLA2G4AP47712 749 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 ALDH1A3P47895 512 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 PDCLQ13371 301 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 SLC18A3Q16572 532 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 PMF1Q6P1K2 205 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC170Q8IYT3 715 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 WDTC1Q8N5D0 677 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 MYLIPQ8WY64 445 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 SPTLC3Q9NUV7 552 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 DPP7Q9UHL4 492 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 CYTH4Q9UIA0 394 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 UNGP13051 313 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 ATF6P18850 670 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 CENPCQ03188 943 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 TWF1Q12792 350 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 GPR152Q8TDT2 470 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 PNPLA8Q9NP80 782 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 TAS2R14Q9NYV8 317 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 LRG1P02750 347 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 HYAL1Q12794 435 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 PLD1Q13393 1074 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 MTF1Q14872 753 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 PPM1LQ5SGD2 360 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 RAD9BQ6WBX8 426 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 MICALL1Q8N3F8 863 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 MSANTD4Q8NCY6 345 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 STKLD1Q8NE28 680 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 GIPC2Q8TF65 315 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 SYNCQ9H7C4 482 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 NAGPAQ9UK23 515 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 DOCK6Q96HP0 2047 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 PIK3R2O00459 728 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 GZMAP12544 262 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 CCZ1BP86790 482 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 VEPH1Q14D04 833 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 PTPN20Q4JDL3 420 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC122Q5T0U0 273 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 ERICH1Q86X53 443 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 STK32AQ8WU08 396 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 HSFY1Q96LI6 401 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 CPXM1Q96SM3 734 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 LRRC4Q9HBW1 653 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 HHLA1C9JL84 531 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 NDUFA10O95299 355 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
HOXA4-202ENST00000428284 SLC5A3P53794 718 aa21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms