RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 VPS41P49754 854 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CXCL9Q07325 125 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF220Q5VTB9 566 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TAOK1Q7L7X3 1001 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM192Q8IY95 271 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf127Q8N9H9 656 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDH19Q8TAB3 1148 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 EBF4Q9BQW3 602 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP26B1Q9NR63 512 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PCMTD2Q9NV79 361 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR35Q9P2L0 1181 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ASIC3Q9UHC3 531 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MTUS1Q9ULD2 1270 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHGB4Q9UN71 923 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FCHO1O14526 889 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KDELR1P24390 212 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CHRNA5P30532 468 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 STIP1P31948 543 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SEMA3BQ13214 749 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KIFAP3Q92845 792 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PANX3Q96QZ0 392 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SELENOSQ9BQE4 189 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF341Q9BYN7 854 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf21Q9H246 121 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXO40Q9UH90 709 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1B0GVG6 124 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SDR42E2A6NKP2 422 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXO21O94952 628 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ELK3P41970 407 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 OVGP1Q12889 678 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TMCO4Q5TGY1 634 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD35Q8N283 1001 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MAPK15Q8TD08 544 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 NLRP4Q96MN2 994 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SCLT1Q96NL6 688 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ELOVL4Q9GZR5 314 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF487B1APH4 448 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBTB14O43829 449 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 B4GALT4O60513 344 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TM7SF2O76062 418 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KRT4P19013 534 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CA4P22748 312 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 NSFP46459 744 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 JAK3P52333 1124 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CDK16Q00536 496 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 XYLT1Q86Y38 959 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TTLL6Q8N841 843 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD42Q8N9B4 389 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC37BQ96QE4 947 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL11Q9NVR0 708 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 UBAP1Q9NZ09 502 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PLLPQ9Y342 182 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SBF1O95248 1867 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 C2orf71A6NGG8 1288 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 DLGAP1O14490 977 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 THAP12O43422 761 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMG1O95456 288 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RAD23BP54727 409 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKCEQ02156 737 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM132BQ14DG7 1078 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MBLAC2Q68D91 279 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM72Q6ZMU5 477 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TIFABQ6ZNK6 161 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KBTBD6Q86V97 674 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 LILRA2Q8N149 483 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 STON2Q8WXE9 905 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 APOPT1Q96IL0 206 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 NRCAMQ92823 1304 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MAFGO15525 162 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 UGT1A9O60656 530 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CILPO75339 1184 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 AVILO75366 819 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 LYNP07948 512 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MARK3P27448 753 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GRIA1P42261 906 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MYL6P60660 151 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 AOC3Q16853 763 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TFDP3Q5H9I0 405 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 OLFML1Q6UWY5 402 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MCUQ8NE86 351 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CAMKK2Q96RR4 588 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 NUDCD1Q96RS6 583 aa3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms