RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 NT5DC4Q86YG4 428 aa24.93■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 CXorf38Q8TB03 319 aa24.93■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 TMEM176AQ96HP8 235 aa24.93■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 TMEM121Q9BTD3 319 aa24.93■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 ASNSD1Q9NWL6 643 aa24.93■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 ERAP1Q9NZ08 941 aa24.93■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 STARD13Q9Y3M8 1113 aa24.93■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 CST8O60676 142 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 RNF8O76064 485 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 GH1P01241 217 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 APOC2P02655 101 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 SPARCL1Q14515 664 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 TTLL4Q14679 1199 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 NAT8LQ8N9F0 302 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 ATP11CQ8NB49 1132 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 JOSD2Q8TAC2 188 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 NLRP4Q96MN2 994 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 SMC6Q96SB8 1091 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 MMP19Q99542 508 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 TRABDQ9H4I3 376 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 RSAD1Q9HA92 442 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 ENDOD1O94919 500 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 C22orf31O95567 290 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 CXCL8P10145 99 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 ETS1P14921 441 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 ZBED8Q8IZ13 594 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 CPXM1Q96SM3 734 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 ABCF3Q9NUQ8 709 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 SAGE1Q9NXZ1 904 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 KLHL14Q9P2G3 628 aa24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 A0A1B0GUA9 196 aa24.91■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 ASB14A6NK59 587 aa24.91■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA8SH3BPF8 625 aa24.91■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 GPR25O00155 361 aa24.91■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 B4GALT5O43286 388 aa24.91■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 IL1R2P27930 398 aa24.91■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 ADORA2AP29274 412 aa24.91■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 STIP1P31948 543 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 WDR4P57081 412 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 GRB14Q14449 540 aa24.91■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 LINC01465Q8N7H1 131 aa24.91■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 VPS37BQ9H9H4 285 aa24.91■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 COL1A2P08123 1366 aa24.91■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 LACTBL1A8MY62 500 aa24.9■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 STAG3L1P0CL83 205 aa24.9■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 SLC8A1P32418 973 aa24.9■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 SP3Q02447 781 aa24.9■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 INCA1Q0VD86 236 aa24.9■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 STILQ15468 1287 aa24.9■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 KLHL38Q2WGJ6 581 aa24.9■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.9■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 GDAP1Q8TB36 358 aa24.9■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 RSAD2Q8WXG1 361 aa24.9■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 CPT1BQ92523 772 aa24.9■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 DHRS4Q9BTZ2 278 aa24.9■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 PITPNM3Q9BZ71 974 aa24.9■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 SDCBP2Q9H190 292 aa24.9■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 SYNCQ9H7C4 482 aa24.9■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 IFT122Q9HBG6 1241 aa24.9■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 ATP2C2O75185 946 aa24.89■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 UBOX5O94941 541 aa24.89■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 ERBB2P04626 1255 aa24.89■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 KRT19P08727 400 aa24.89■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 TXNP10599 105 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 GPD2P43304 727 aa24.89■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 AMHR2Q16671 573 aa24.89■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 MORN1Q5T089 497 aa24.89■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 VSIG1Q86XK7 387 aa24.89■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa24.89■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 CEP120Q8N960 986 aa24.89■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 GJD2Q9UKL4 321 aa24.89■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 MICAL2O94851 1124 aa24.89■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 IFNB1P01574 187 aa24.89■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 NFICP08651 508 aa24.89■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 PDK4Q16654 411 aa24.89■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 KCTD6Q8NC69 237 aa24.89■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 AFG1LQ8WV93 481 aa24.89■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 NCAPGQ9BPX3 1015 aa24.89■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 CNPY3Q9BT09 278 aa24.89■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 ELOVL4Q9GZR5 314 aa24.89■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 ACSS3Q9H6R3 686 aa24.89■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 MINDY3Q9H8M7 445 aa24.89■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 ZWILCHQ9H900 591 aa24.89■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 RABGEF1Q9UJ41 708 aa24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms