RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 DERAQ9Y315 318 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 IPPQ9Y573 584 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 CDY2AQ9Y6F7 541 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRD1A4D1F6 860 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM88BA6NKF7 163 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 E5RJQ4 531 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 TULP2O00295 520 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 AOC2O75106 756 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS6KA5O75582 802 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHA2P01877 340 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 ELNP15502 786 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 KRT17Q04695 432 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 ADCY2Q08462 1091 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 SOWAHAQ2M3V2 549 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXO47Q5MNV8 452 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 CEP85LQ5SZL2 805 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 TAF2Q6P1X5 1199 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 LCLAT1Q6UWP7 414 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 RCOR2Q8IZ40 523 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC39CQ8N584 583 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC52Q8N7C0 313 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 ARRDC4Q8NCT1 418 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 ATL2Q8NHH9 583 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 RAPGEF5Q92565 580 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 ZFP42Q96MM3 310 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 RUNDC3BQ96NL0 473 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 DCLK3Q9C098 648 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 KIAA1257Q9ULG3 409 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 NME7Q9Y5B8 376 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 CEP350Q5VT06 3117 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 ANK1P16157 1881 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 ERICH4A6NGS2 130 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 MEIS3P2A8K0S8 358 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 KPNA7A9QM74 516 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 GOLGA8KD6RF30 607 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 SEPT4O43236 478 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 XPOTO43592 962 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 KPNA6O60684 536 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 LRCH4O75427 683 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 CD4P01730 458 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 ASGR1P07306 291 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 LMO2P25791 158 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 DRG2P55039 364 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 CAP1Q01518 475 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 CALCOCO2Q13137 446 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 HADHQ16836 314 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 TTMPQ5BVD1 217 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF618Q5T7W0 954 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 ZDHHC24Q6UX98 284 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 GSTA5Q7RTV2 222 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 TMC3Q7Z5M5 1100 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 RSPH3Q86UC2 560 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC25Q86WR0 208 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC30AQ86WT1 665 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 SH2D3CQ8N5H7 860 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM76AQ8TAV0 307 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 WNT8BQ93098 351 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 EXOC4Q96A65 974 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 HAUS1Q96CS2 278 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 SLITRK1Q96PX8 696 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 SH3GL2Q99962 352 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAIPQ9BWF2 469 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 DPEP3Q9H4B8 488 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 GRHL1Q9NZI5 618 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 HESX1Q9UBX0 185 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 CITO14578 2027 aa4.18□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 TRPM7Q96QT4 1865 aa4.18□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF236Q9UL36 1845 aa4.18□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 PIRO00625 290 aa4.18□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF8O76064 485 aa4.18□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 TJP3O95049 919 aa4.18□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 GAS8O95995 478 aa4.18□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 ALDH1A1P00352 501 aa4.18□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 PFKMP08237 780 aa4.18□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 PDGFRAP16234 1089 aa4.18□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 IL1R2P27930 398 aa4.18□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 ADORA2BP29275 332 aa4.18□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 HOXC8P31273 242 aa4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms