RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNA3P22001 575 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 SPIDRQ14159 915 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 IKBKEQ14164 716 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 KDM7AQ6ZMT4 941 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 EPHX4Q8IUS5 362 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 NOSTRINQ8IVI9 506 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 UBR7Q8N806 425 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 SCFD2Q8WU76 684 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.272e-6■■□□□ 12.9
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RABGEF1-202ENST00000380828 SPATA2Q9UM82 520 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 AXIN1O15169 862 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ADAM11O75078 769 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 POLBP06746 335 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 RXRAP19793 462 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 GARTP22102 1010 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC9A3P48764 834 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 GSK3AP49840 483 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 COG7P83436 770 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 DMC1Q14565 340 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 GNASQ5JWF2 1037 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR49Q8IV35 697 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP8B4Q8TF62 1192 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 COQ3Q9NZJ6 369 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CLRN2A0PK11 232 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 E9PBE3 544 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 IDH3BO43837 385 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PLOD3O60568 738 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 NR4A1P22736 598 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 HOXA6P31267 233 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 RTP1P59025 263 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 DOC2AQ14183 400 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 DPP9Q86TI2 863 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 BBS5Q8N3I7 341 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 AGXT2Q9BYV1 514 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 EPN3Q9H201 632 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA1586Q9HCI6 787 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 SACM1LQ9NTJ5 587 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 COG5Q9UP83 839 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 MTMR6Q9Y217 621 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 VWA7Q9Y334 891 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 VSTM5A8MXK1 200 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PFDN6O15212 129 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CLOCKO15516 846 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 SEMA3DO95025 777 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 GAS8O95995 478 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 FUCA1P04066 466 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PFKLP17858 780 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 MAPK9P45984 424 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ACADVLP49748 655 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 RANBP10Q6VN20 620 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 RGS9BPQ6ZS82 235 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 EFHBQ8N7U6 833 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 TSPEARQ8WU66 669 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 NAT14Q8WUY8 206 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC22A18Q96BI1 424 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PKP4Q99569 1192 aa7.11□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 NLRC4Q9NPP4 1024 aa7.11□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 COQ6Q9Y2Z9 468 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF804BA4D1E1 1349 aa7.11□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 FSCN2O14926 492 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 LDLRAD4O15165 306 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 ITGALP20701 1170 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 XPAP23025 273 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 SHMT1P34896 483 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 IARSP41252 1262 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PHC1P78364 1004 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 COTL1Q14019 142 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 UGP2Q16851 508 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.11□□□□□ -1.27
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