RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377244.7

SNX15-202, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX15, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-202ENST00000377244 SPPL3Q8TCT6 385 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 RFFLQ8WZ73 363 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 C18orf8Q96DM3 657 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 PLVAPQ9BX97 442 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 SLC4A5Q9BY07 1137 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 C5orf67F2Z3F1 127 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 F8VP50 259 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 CYP1A2P05177 515 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 CALB1P05937 261 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 SLC8A3P57103 927 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 CFAP221Q4G0U5 840 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 TDHQ8IZJ6 230 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 POF1BQ8WVV4 589 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 VCPIP1Q96JH7 1222 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 LILRB3O75022 631 aa26.79■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 SOAT2O75908 522 aa26.79■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 BMP8BP34820 402 aa26.79■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa26.79■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 TMC7Q7Z402 723 aa26.79■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 XYLT1Q86Y38 959 aa26.79■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 STKLD1Q8NE28 680 aa26.79■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 TCF25Q9BQ70 676 aa26.79■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 NUP85Q9BW27 656 aa26.79■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa26.79■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa26.79■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa26.79■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 MYO7AQ13402 2215 aa26.79■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 GOLGA8SH3BPF8 625 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 GRM6O15303 877 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 LCP1P13796 627 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 NOP2P46087 812 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 GPR15P49685 360 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 LIN9Q5TKA1 542 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 SCN4BQ8IWT1 228 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 STK32AQ8WU08 396 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 TRIM11Q96F44 468 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 MIS12Q9H081 205 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 HHLA1C9JL84 531 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 MYBL1P10243 752 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 GRIK1P39086 918 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 GABRB2P47870 512 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 ADCY1Q08828 1119 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 ADIGQ0VDE8 80 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 SDHAF4Q5VUM1 108 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 CHRDL2Q6WN34 429 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 TMEM110Q86TL2 294 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 SCUBE3Q8IX30 993 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 MSANTD4Q8NCY6 345 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 CLEC4CQ8WTT0 213 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 TRIM7Q9C029 511 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 TEX28O15482 410 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 ERVK-21P61565 698 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 DUSP4Q13115 394 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 PLPP4Q5VZY2 271 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 NYAP1Q6ZVC0 841 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 LZTS1Q9Y250 596 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 BTNL10A8MVZ5 291 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 CXCL14O95715 111 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 CNPP09543 421 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 RPL34P49207 117 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 NDUFV1P49821 464 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 MAMLD1Q13495 774 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 CAMK1Q14012 370 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 DDR2Q16832 855 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 BTBD6Q96KE9 485 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 GOLPH3Q9H4A6 298 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 STK39Q9UEW8 545 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 PATJQ8NI35 1801 aa26.76■■□□□ 1.88
SNX15-202ENST00000377244 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
SNX15-202ENST00000377244 PPP2R2DQ66LE6 453 aa26.76■■□□□ 1.87
SNX15-202ENST00000377244 OR6B2Q6IFH4 312 aa26.76■■□□□ 1.87
SNX15-202ENST00000377244 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
SNX15-202ENST00000377244 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SNX15-202ENST00000377244 HSFY1Q96LI6 401 aa26.76■■□□□ 1.87
SNX15-202ENST00000377244 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
SNX15-202ENST00000377244 TLR9Q9NR96 1032 aa26.76■■□□□ 1.87
SNX15-202ENST00000377244 MSRAQ9UJ68 235 aa26.76■■□□□ 1.87
SNX15-202ENST00000377244 STRIP2Q9ULQ0 834 aa26.76■■□□□ 1.87
SNX15-202ENST00000377244 TRANK1O15050 2925 aa26.75■■□□□ 1.87
SNX15-202ENST00000377244 HIDE1A8MVS5 230 aa26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms