RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371746.7

LHX3-201, Transcript of LIM homeobox 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX3, Length 2,403 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3-201ENST00000371746 USP18Q9UMW8 372 aa24.94■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 ZNF148Q9UQR1 794 aa24.94■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 ADAMTS4O75173 837 aa24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 CHKAP35790 457 aa24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 LILRA4P59901 499 aa24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 KRT71Q3SY84 523 aa24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 DENND2CQ68D51 928 aa24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 OLFML1Q6UWY5 402 aa24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 SERINC5Q86VE9 423 aa24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 APPL2Q8NEU8 664 aa24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 TMEM88BA6NKF7 163 aa24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 ASGR1P07306 291 aa24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 ITIH2P19823 946 aa24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 GPD1P21695 349 aa24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 PNPLA4P41247 253 aa24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 CCDC142Q17RM4 750 aa24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 RHBDF2Q6PJF5 856 aa24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 CFAP57Q96MR6 1250 aa24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 CNPY3Q9BT09 278 aa24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 SLC4A5Q9BY07 1137 aa24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 MIS12Q9H081 205 aa24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 SNX25Q9H3E2 840 aa24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 ASNSD1Q9NWL6 643 aa24.93■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 AOC2O75106 756 aa24.92■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 KDELR1P24390 212 aa24.92■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 MLH1P40692 756 aa24.92■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 ATP11AP98196 1134 aa24.92■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 SPDYCQ5MJ68 293 aa24.92■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 RSPH3Q86UC2 560 aa24.92■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 LPPQ93052 612 aa24.92■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 PWWP2AQ96N64 755 aa24.92■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa24.92■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 KLRC2P26717 231 aa24.92■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 PPARDQ03181 441 aa24.92■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 KCNA10Q16322 511 aa24.92■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 CCDC89Q8N998 374 aa24.92■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 KCTD6Q8NC69 237 aa24.92■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 FAM105AQ9NUU6 356 aa24.92■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 HPDP32754 393 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 PLCB3Q01970 1234 aa24.91■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 SV2CQ496J9 727 aa24.91■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 ARHGAP17Q68EM7 881 aa24.91■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 TMEM110Q86TL2 294 aa24.91■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 ADGRF2Q8IZF7 708 aa24.91■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 CST8O60676 142 aa24.91■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 HUS1O60921 280 aa24.91■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 NUDT17P0C025 328 aa24.91■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 RARGP13631 454 aa24.91■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 ETS1P14921 441 aa24.91■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 NR1D1P20393 614 aa24.91■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 SLMAPQ14BN4 828 aa24.91■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 GSTCDQ8NEC7 633 aa24.91■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 SLC2A14Q8TDB8 520 aa24.91■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 GAD1Q99259 594 aa24.91■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 TMEM121Q9BTD3 319 aa24.91■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 ANAPC5Q9UJX4 755 aa24.91■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 CCDC14Q49A88 953 aa24.9■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 CRYBG2Q8N1P7 616 aa24.9■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 CLEC4CQ8WTT0 213 aa24.9■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 CALN1Q9BXU9 219 aa24.9■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 FAM129AQ9BZQ8 928 aa24.9■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 C10orf88Q9H8K7 445 aa24.9■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 RNF186Q9NXI6 227 aa24.9■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 GRIN2DO15399 1336 aa24.9■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 DCDC2CA8MYV0 355 aa24.9■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 RIPK2O43353 540 aa24.9■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 ACAP1Q15027 740 aa24.9■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 P3H1Q32P28 736 aa24.9■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 OSTM1Q86WC4 334 aa24.9■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 TRAIPQ9BWF2 469 aa24.9■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 CAPS2Q9BXY5 557 aa24.9■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 ATP2C2O75185 946 aa24.89■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 SETSIPP0DME0 302 aa24.89■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 PCK1P35558 622 aa24.89■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 THPOP40225 353 aa24.89■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 VCPP55072 806 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 SLC6A3Q01959 620 aa24.89■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 OASLQ15646 514 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 IZUMO3Q5VZ72 239 aa24.89■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 LIMS2Q7Z4I7 341 aa24.89■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 ACTL9Q8TC94 416 aa24.89■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 TSPAN18Q96SJ8 248 aa24.89■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
LHX3-201ENST00000371746 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms