RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368045.3

CD48-201, Transcript of CD48 molecule, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CD48, Length 1,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48-201ENST00000368045 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 STK38LQ9Y2H1 464 aa14.96□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 A0A0G2JMZ2 1700 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 CILPO75339 1184 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 TMEM63AO94886 807 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 ENDOD1O94919 500 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 VDRP11473 427 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 SSTR1P30872 391 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 CCNG1P51959 295 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 SLC8A3P57103 927 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 NOMO1Q15155 1222 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 KYAT1Q16773 422 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 LY6KQ17RY6 165 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 TMEM132AQ24JP5 1023 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 BBS9Q3SYG4 887 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 KCNT1Q5JUK3 1230 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 CHSY1Q86X52 802 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 UNC45BQ8IWX7 931 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 LRRC71Q8N4P6 559 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 TMEM176AQ96HP8 235 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 CNPY3Q9BT09 278 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 TUBB6Q9BUF5 446 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 USP18Q9UMW8 372 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 FZD1Q9UP38 647 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 TRIM33Q9UPN9 1127 aa14.95□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 E7ENQ6 273 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 CHADO15335 359 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 HBP1O60381 514 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 BANF1O75531 89 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 FAM155BO75949 473 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 MICAL2O94851 1124 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 SLC25A27O95847 323 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 MT-ND3P03897 115 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 KRT19P08727 400 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 RBP3P10745 1247 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 MCF2P10911 925 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 MARK3P27448 753 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 MBTD1Q05BQ5 628 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 FAM187BQ17R55 369 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 TREML2Q5T2D2 321 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 EEF1DP3Q658K8 133 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 NCAPG2Q86XI2 1143 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 CCDC125Q86Z20 511 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 GPATCH11Q8N954 259 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 C1orf127Q8N9H9 656 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 FAM71DQ8N9W8 422 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 ELOVL4Q9GZR5 314 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 SDCBP2Q9H190 292 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 ASB7Q9H672 318 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 PNPLA8Q9NP80 782 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 GGA3Q9NZ52 723 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 TJP2Q9UDY2 1190 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 KIAA1257Q9ULG3 409 aa14.94□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 CFAP69A5D8W1 941 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 IL1BP01584 269 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 CD48P09326 243 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 CXCL8P10145 99 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 BAG6P46379 1132 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 RAP1GAPP47736 663 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 GAD2Q05329 585 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 ACCSLQ4AC99 568 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 EMC1Q8N766 993 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 SPATA18Q8TC71 538 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 NSMCE1Q8WV22 266 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 SLC44A1Q8WWI5 657 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 APBB2Q92870 758 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 ADPGKQ9BRR6 497 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 BATF3Q9NR55 127 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 PCSK1NQ9UHG2 260 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 L3MBTL1Q9Y468 752 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 IKBKGQ9Y6K9 419 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 M0QYV0 167 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 TGDSO95455 350 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 STAU1O95793 577 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 DHRS4L1P0CG22 281 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 GPD1P21695 349 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 ADRA1DP25100 572 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 GPD2P43304 727 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 PHKA2P46019 1235 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 BASP1P80723 227 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 KCNJ11Q14654 390 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 PDK2Q15119 407 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 STILQ15468 1287 aa14.93□□□□□ -0.02
CD48-201ENST00000368045 WASHC2DQ5SRD0 308 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms