RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367367.8

PTPRC-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 2,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-203ENST00000367367 STK4Q13043 487 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 BRD3Q15059 726 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 POSTNQ15063 836 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 TMEM95Q3KNT9 176 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 TIGD5Q53EQ6 642 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 LYPD4Q6UWN0 246 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 Q6ZVU0 165 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 SYCP3Q8IZU3 236 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 VPS52Q8N1B4 723 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 SLC17A8Q8NDX2 589 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 TTC16Q8NEE8 873 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 ENGASEQ8NFI3 743 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 MYRIPQ8NFW9 859 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 RHBDD1Q8TEB9 315 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 SCFD1Q8WVM8 642 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 KCNN1Q92952 543 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 ACAP3Q96P50 834 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 GPR62Q9BZJ7 368 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 GRIP2Q9C0E4 1043 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 LRRC27Q9C0I9 530 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 MUC3BQ9H195 1237 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 PCIF1Q9H4Z3 704 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 IGFLR1Q9H665 355 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 UBN1Q9NPG3 1134 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 EXOC1Q9NV70 894 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 SPG21Q9NZD8 308 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 KCNG1Q9UIX4 513 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 FAM50BQ9Y247 325 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 TECTAO75443 2155 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 HELZP42694 1942 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 PATJQ8NI35 1801 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 MIA3Q5JRA6 1907 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 TTC26A0AVF1 554 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 BLACEA4D250 179 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 H3BQ06 376 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 I3L4J1 428 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 PPEF2O14830 753 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 CLIC2O15247 247 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 OGTO15294 1046 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 TGFB1I1O43294 461 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 TBX10O75333 385 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 B3GAT3O94766 335 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 ECEL1O95672 775 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 GLP2RO95838 553 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 CAPNS1P04632 268 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 RPN1P04843 607 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 ALDH2P05091 517 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 NFICP08651 508 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 KCNA5P22460 613 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 NRIP1P48552 1158 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 KCNQ1P51787 676 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 TMPRSS15P98073 1019 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 KRT17Q04695 432 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 PPP2R3AQ06190 1150 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 HYAL1Q12794 435 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 TUSC3Q13454 348 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 SF1Q15637 639 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 CLUL1Q15846 466 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 NXNQ6DKJ4 435 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 ARMCX5Q6P1M9 558 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 FUT10Q6P4F1 479 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 ABHD17CQ6PCB6 329 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 ALKAL1Q6UXT8 129 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 TAS1R1Q7RTX1 841 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 CBWD2Q8IUF1 395 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 EFCAB13Q8IY85 973 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 FEZF2Q8TBJ5 459 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 RSPH1Q8WYR4 309 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 RELTQ969Z4 430 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 HVCN1Q96D96 273 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 EEF2KMTQ96G04 330 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 ACCSQ96QU6 501 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 FAM213AQ9BRX8 229 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 TMEM175Q9BSA9 504 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 ZBP1Q9H171 429 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 SMOC1Q9H4F8 434 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 CLDND1Q9NY35 253 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 APEX2Q9UBZ4 518 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 CDH22Q9UJ99 828 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 ADAM28Q9UKQ2 775 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 EXOC7Q9UPT5 735 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms