RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 GLRA3O75311 464 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 KCNK10P57789 538 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 AGAP9Q5VTM2 703 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 DENND1BQ6P3S1 775 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 SLFN11Q7Z7L1 901 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 FAM172AQ8WUF8 416 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 HEATR9A2RTY3 570 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 TIMM44O43615 452 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC74AQ0VAA2 488 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC36Q1X8D7 754 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 KDM7AQ6ZMT4 941 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 FAM111AQ96PZ2 611 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO21O94952 628 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 POU4F1Q01851 419 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ORC1Q13415 861 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 BTNL9Q6UXG8 535 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 MDM1Q8TC05 714 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ADNPQ9H2P0 1102 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM161AQ9NX61 479 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 RGL2O15211 777 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 SHMT1P34896 483 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 PTPN7P35236 360 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 MYL6P60660 151 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 TGFB2P61812 414 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 KLC1Q07866 573 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 WASHC5Q12768 1159 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 UGT3A1Q6NUS8 523 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO25Q8TCJ0 367 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 AAASQ9NRG9 546 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 MEGF6O75095 1541 aa21.02■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 FKBP9O95302 570 aa21.02■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC15Q0P6D6 951 aa21.02■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 FKBP9P1Q75LS8 142 aa21.02■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 SNX31Q8N9S9 440 aa21.02■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO36Q8NEA4 188 aa21.02■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 APOL5Q9BWW9 433 aa21.02■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC40Q9H9A6 602 aa21.02■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 YY1P25490 414 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 CASP7P55210 303 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 STX5Q13190 355 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 CCNG2Q16589 344 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 ADGRF2Q8IZF7 708 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 SGF29Q96ES7 293 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 C2orf81A6NN90 581 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 HLA-DPA1P20036 260 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 RARRES1P49788 294 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 DMC1Q14565 340 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 MIB1Q86YT6 1006 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM176AQ96HP8 235 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 FUT8Q9BYC5 575 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 OSGEPQ9NPF4 335 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 EVPLLA8MZ36 301 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 FBXW10Q5XX13 1052 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 HS6ST3Q8IZP7 471 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 ITM2BQ9Y287 266 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 H7C4K7 107 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 HERVK_113P62684 666 aa21.01■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 H3BRB1 525 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 THP07101 528 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 C3orf20Q8ND61 904 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 L1RE1Q9UN81 338 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 F5H5T6 163 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 HOXA2O43364 376 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 VTNP04004 478 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO32Q969P5 355 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC126Q96EE4 140 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 WNK4Q96J92 1243 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 IL17RBQ9NRM6 502 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 DSEQ9UL01 958 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 USP18Q9UMW8 372 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 ADGRA2Q96PE1 1338 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 MAP3K6O95382 1288 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 LRG1P02750 347 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 KIF2BQ8N4N8 673 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 BRD8Q9H0E9 1235 aa21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms