RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRR3P79522 188 aaKnown RBP-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 APBA1Q02410 837 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLP2Q04941 152 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MBTD1Q05BQ5 628 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIAA2012Q0VF49 1180 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LCP2Q13094 533 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAMLD1Q13495 774 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ITGA7Q13683 1181 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRIT3Q3SXY7 679 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CDONQ4KMG0 1287 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GPR158Q5T848 1215 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IQSEC1Q6DN90 963 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC23A3Q6PIS1 610 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF788Q6ZQV5 615 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PODNQ7Z5L7 613 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OSTM1Q86WC4 334 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAP4K3Q8IVH8 894 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLF2Q8IX21 1173 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CNTROBQ8N137 903 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRSS35Q8N3Z0 413 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CLDN19Q8N6F1 224 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF645Q8N7E2 425 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC00482Q8N8I6 264 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WDR31Q8NA23 367 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANKLE1Q8NAG6 615 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GPR156Q8NFN8 814 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR52K1Q8NGK4 314 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR5L2Q8NGL0 311 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DLG3Q92796 817 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GJA10Q969M2 543 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMARCD1Q96GM5 515 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRERF1Q96PN7 1200 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF607Q96SK3 696 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OSMRQ99650 979 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MMP28Q9H239 520 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EBF2Q9HAK2 575 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CYTL1Q9NRR1 136 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 THSD1Q9NS62 852 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VPS54Q9P1Q0 977 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NACADO15069 1562 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1B0GTH6 734 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1W2PNR3 127 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM205CA6NFA0 338 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A6NL46 340 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF839A8K0R7 811 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SERPINE3A8MV23 424 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A8MZ25 164 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 H7C1H1 209 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNFRSF10CO14798 259 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NBNO60934 754 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PROP1O75360 226 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ALDH1A2O94788 518 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RAB36O95755 333 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CFDP00746 253 aaPredicted RBP-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ASGR2P07307 311 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GJB1P08034 283 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MMP10P09238 476 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KLK2P20151 261 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ITPKAP23677 461 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNFRSF8P28908 595 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FCGR2CP31995 323 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 INPP5BP32019 993 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GATA4P43694 442 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GLIPR1P48060 266 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC11A1P49279 550 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CRISP3P54108 245 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 E2F2Q14209 437 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GSE1Q14687 1217 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF827Q17R98 1081 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LEXMQ3ZCV2 418 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC18B1Q6NT16 456 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF836Q6ZNA1 936 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MICALL2Q8IY33 904 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GPR135Q8IZ08 494 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZMIZ2Q8NF64 920 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM76AQ8TAV0 307 aa-3.18□□□□□ -2.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms