RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 PTP4A2Q12974 167 aa6.38□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 RCN1Q15293 331 aa6.38□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 CD300LGQ6UXG3 332 aa6.38□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.38□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 ATP11CQ8NB49 1132 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 UBA3Q8TBC4 463 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 HASPINQ8TF76 798 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 CENPTQ96BT3 561 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.37□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 TET1Q8NFU7 2136 aa6.37□□□□□ -1.39
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