RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 HADHQ16836 314 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 TTC27Q6P3X3 843 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 CD300LGQ6UXG3 332 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 PAQR9Q6ZVX9 377 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 CNPY3Q9BT09 278 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 LRRC19Q9H756 370 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 FAM53CQ9NYF3 392 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 NFU1Q9UMS0 254 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 I3L4J1 428 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 CLDN5O00501 218 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 KRT7P08729 469 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 FLT3P36888 993 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 COILP38432 576 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 ACADSBP45954 432 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 BRCC3P46736 316 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 ODF2Q5BJF6 829 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 TRNP1Q6NT89 227 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 SYT15Q9BQS2 421 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 WBP1LQ9NX94 342 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 OGFRQ9NZT2 677 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 FAM187AA6NFU0 413 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 LCP1P13796 627 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 IL1R2P27930 398 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 PLCB3Q01970 1234 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 CUL1Q13616 776 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 NOMO2Q5JPE7 1267 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 EMBQ6PCB8 327 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 HASPINQ8TF76 798 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 C1orf54Q8WWF1 131 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 RUNDC3BQ96NL0 473 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 MED10Q9BTT4 135 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 ZWILCHQ9H900 591 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 CDH9Q9ULB4 789 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 M0QZQ0 153 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 NPR3P17342 541 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 PTGIRP43119 386 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 FNTAP49354 379 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 COPS2P61201 443 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 MFSD7Q6UXD7 560 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 PIGZQ86VD9 579 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 JAMLQ86YT9 394 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 URGCPQ8TCY9 931 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 SEC14L1Q92503 715 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 RAPGEF5Q92565 580 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 RAB17Q9H0T7 212 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 TMEM161AQ9NX61 479 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 MYBPHLA2RUH7 354 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 ENPP3O14638 875 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 DDHD2O94830 711 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 CYP11A1P05108 521 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 COL6A1P12109 1028 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 PCSK1P29120 753 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 MIPP30301 263 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 PCK1P35558 622 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 SMTNL2Q2TAL5 461 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 CCDC14Q49A88 953 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 KCNT1Q5JUK3 1230 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 METTL23Q86XA0 190 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 ZNF280BQ86YH2 543 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 SPATA18Q8TC71 538 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 RSPH1Q8WYR4 309 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 ERP44Q9BS26 406 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 KANSL3Q9P2N6 904 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 PCSK1NQ9UHG2 260 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 DSEQ9UL01 958 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 USP18Q9UMW8 372 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 LRRD1A4D1F6 860 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 DAPK3O43293 454 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 BEST1O76090 585 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 ITGB1P05556 798 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 KCNJ1P48048 391 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 CDR1P51861 262 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 TFDP3Q5H9I0 405 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms