RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307886.7

CTSW-201, Transcript of cathepsin W, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTSW, Length 1,300 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-201ENST00000307886 TRPC7Q9HCX4 862 aa16.28■□□□□ 0.2
CTSW-201ENST00000307886 EXOC1Q9NV70 894 aa16.28■□□□□ 0.2
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CTSW-201ENST00000307886 USP25Q9UHP3 1055 aa16.28■□□□□ 0.2
CTSW-201ENST00000307886 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
CTSW-201ENST00000307886 HELZP42694 1942 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
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CTSW-201ENST00000307886 A0A1W2PQD8 194 aa16.23■□□□□ 0.19
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CTSW-201ENST00000307886 SLC7A9P82251 487 aa16.23■□□□□ 0.19
CTSW-201ENST00000307886 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP16.23■□□□□ 0.19
CTSW-201ENST00000307886 ZNF667Q5HYK9 610 aa16.23■□□□□ 0.19
CTSW-201ENST00000307886 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
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CTSW-201ENST00000307886 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa16.23■□□□□ 0.19
CTSW-201ENST00000307886 KRBA2Q6ZNG9 492 aa16.23■□□□□ 0.19
CTSW-201ENST00000307886 FUKQ8N0W3 1084 aa16.23■□□□□ 0.19
CTSW-201ENST00000307886 TTC16Q8NEE8 873 aa16.23■□□□□ 0.19
CTSW-201ENST00000307886 ZMIZ2Q8NF64 920 aa16.23■□□□□ 0.19
CTSW-201ENST00000307886 SCAMP5Q8TAC9 235 aa16.23■□□□□ 0.19
CTSW-201ENST00000307886 ELOVL4Q9GZR5 314 aa16.23■□□□□ 0.19
CTSW-201ENST00000307886 IL37Q9NZH6 218 aa16.23■□□□□ 0.19
CTSW-201ENST00000307886 HMGXB4Q9UGU5 601 aa16.23■□□□□ 0.19
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