RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BORAQ6PGQ7 559 aa23.69■■□□□ 1.38
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BTBD7Q9P203 1132 aa23.69■■□□□ 1.38
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IP6K2Q9UHH9 426 aa23.68■■□□□ 1.38
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HAUS6Q7Z4H7 955 aa23.67■■□□□ 1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PASD1Q8IV76 773 aa23.67■■□□□ 1.38
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa23.67■■□□□ 1.38
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WDR37Q9Y2I8 494 aa23.67■■□□□ 1.38
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SENP7Q9BQF6 1050 aa23.66■■□□□ 1.38
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MYLK3Q32MK0 819 aa23.66■■□□□ 1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TEX44Q53QW1 395 aa23.66■■□□□ 1.38
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.66■■□□□ 1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.66■■□□□ 1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF696Q9H7X3 374 aa23.66■■□□□ 1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LZTS1Q9Y250 596 aa23.66■■□□□ 1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa23.66■■□□□ 1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SDR42E2A6NKP2 422 aa23.65■■□□□ 1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HLA-DOAP06340 250 aa23.65■■□□□ 1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CD97P48960 835 aa23.65■■□□□ 1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PHEXP78562 749 aa23.65■■□□□ 1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC25A3Q00325 362 aa23.65■■□□□ 1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADRM1Q16186 407 aa23.65■■□□□ 1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP41Q3LFD5 358 aa23.65■■□□□ 1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TFDP3Q5H9I0 405 aa23.65■■□□□ 1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLX1AQ9BQ83 275 aa23.65■■□□□ 1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SMYD3Q9H7B4 428 aa23.65■■□□□ 1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SIRPGQ9P1W8 387 aa23.65■■□□□ 1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC160A6NGH7 325 aa23.65■■□□□ 1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
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