RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291281.8

PRKD2-201, Transcript of protein kinase D2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKD2, Length 3,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2-201ENST00000291281 XKR9Q5GH70 373 aa16.08■□□□□ 0.17
PRKD2-201ENST00000291281 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa16.08■□□□□ 0.17
PRKD2-201ENST00000291281 DCAKDQ8WVC6 231 aa16.08■□□□□ 0.17
PRKD2-201ENST00000291281 PTPRN2Q92932 1015 aa16.08■□□□□ 0.17
PRKD2-201ENST00000291281 FGD4Q96M96 766 aa16.08■□□□□ 0.17
PRKD2-201ENST00000291281 GGA3Q9NZ52 723 aa16.08■□□□□ 0.17
PRKD2-201ENST00000291281 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa16.08■□□□□ 0.17
PRKD2-201ENST00000291281 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa16.08■□□□□ 0.17
PRKD2-201ENST00000291281 TMEM150BA6NC51 233 aa16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 E7ESA3 106 aa16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 SGK1O00141 431 aa16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 MAGEC1O60732 1142 aa16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 DLDP09622 509 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 HMGCS2P54868 508 aa16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 CUL3Q13618 768 aa16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 UGCGQ16739 394 aa16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 TFDP3Q5H9I0 405 aa16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 PASD1Q8IV76 773 aa16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 WDR60Q8WVS4 1066 aa16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 CCDC28BQ9BUN5 200 aa16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 ADAM33Q9BZ11 813 aa16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 TMEM191CA6NGB0 347 aa16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 TMEM191BP0C7N4 346 aa16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 GNA15P30679 374 aa16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 SSTR1P30872 391 aa16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 ZACNQ401N2 412 aa16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 LRRC6Q86X45 466 aa16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 SLC35B2Q8TB61 432 aa16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 KCNN1Q92952 543 aa16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 HLA-DRAP01903 254 aa16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 CFHP08603 1231 aa16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 SAMD3Q8N6K7 520 aa16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 IL31RAQ8NI17 732 aa16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 ZNF516Q92618 1163 aa16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 TMEM121Q9BTD3 319 aa16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 FEM1BQ9UK73 627 aa16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 LPXNO60711 386 aa16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 BANF1O75531 89 aa16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 DDNO94850 711 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 IFNB1P01574 187 aa16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 ETV4P43268 484 aa16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 NEK3P51956 506 aa16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 FOXB2Q5VYV0 432 aa16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 OLFML1Q6UWY5 402 aa16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 CCDC80Q76M96 950 aa16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 APOPT1Q96IL0 206 aa16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 FAM213AQ9BRX8 229 aa16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 KRT82Q9NSB4 513 aa16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 COL20A1Q9P218 1284 aa16.07■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 KLF11O14901 512 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 MT-ND3P03897 115 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 TCF4P15884 667 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 PGM1P36871 562 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 JAK3P52333 1124 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 CUL2Q13617 745 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 NAT8LQ8N9F0 302 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 CNTN6Q9UQ52 1028 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 GOLGA8SH3BPF8 625 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 GOLGA8MH3BSY2 632 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 FCHO1O14526 889 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 MMP8P22894 467 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 CDKN2BP42772 138 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 PLCB3Q01970 1234 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 MTMR1Q13613 665 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 PSMD6Q15008 389 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 PLA2G4FQ68DD2 849 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 CCDC110Q8TBZ0 833 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 DTX3LQ8TDB6 740 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 CPT1BQ92523 772 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 ATG4CQ96DT6 458 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 ITM2BQ9Y287 266 aa16.06■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 FNBP1LQ5T0N5 605 aa16.05■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 FKBP1CQ5VVH2 108 aa16.05■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 RHPN2Q8IUC4 686 aa16.05■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 ARHGAP18Q8N392 663 aa16.05■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 MTMR14Q8NCE2 650 aa16.05■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 FBXO36Q8NEA4 188 aa16.05■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 BSNDQ8WZ55 320 aa16.05■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PRKD2-201ENST00000291281 DNAJB4Q9UDY4 337 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms