RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272638.13

UBXN4-201, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN4, Length 4,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-201ENST00000272638 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 MON1BQ7L1V2 547 aa13.11□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 UNC45BQ8IWX7 931 aa13.11□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 HASPINQ8TF76 798 aa13.11□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 TRIM55Q9BYV6 548 aa13.11□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 LIASO43766 372 aa13.11□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 MAFO75444 373 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 SLC25A27O95847 323 aa13.11□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 SRGAP2BP0DMP2 458 aa13.11□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 MMP8P22894 467 aa13.11□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 ADRA1DP25100 572 aa13.11□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 KDSRQ06136 332 aa13.11□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 ZPBP2Q6X784 338 aa13.11□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 ARMC2Q8NEN0 867 aa13.11□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 OSBPL7Q9BZF2 842 aa13.11□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 TXNRD2Q9NNW7 524 aa13.11□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 CPA4Q9UI42 421 aa13.11□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 ECM29Q5VYK3 1845 aa13.11□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 TULP2O00295 520 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 DNM1LO00429 736 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 CDC25CP30307 473 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 PEX19P40855 299 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 GEN1Q17RS7 908 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 PPIL6Q8IXY8 311 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 ATP2A3Q93084 1043 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 ABCG1P45844 678 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 ARFIP2P53365 341 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 RABGGTBP53611 331 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 SNAPC2Q13487 334 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 KLHL38Q2WGJ6 581 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 IL31Q6EBC2 164 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 KATNAL2Q8IYT4 538 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 PGBD4Q96DM1 585 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 SGSM3Q96HU1 749 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 COQ4Q9Y3A0 265 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 H0YGN5 161 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 DIAPH2O60879 1101 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 LGALS2P05162 132 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 NUDT17P0C025 328 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 CCDC130P13994 396 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 RASSF2P50749 326 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 KCNJ2P63252 427 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 RIOX2Q8IUF8 465 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 NFS1Q9Y697 457 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM191CA6NGB0 347 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 HMGCRP04035 888 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 TAP1Q03518 808 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 MUM1Q2TAK8 710 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 SCN4BQ8IWT1 228 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 MTMR14Q8NCE2 650 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 UBP1Q9NZI7 540 aa13.1□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 KBTBD13C9JR72 458 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 USP12O75317 370 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 TGFB3P10600 412 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 PYGBP11216 843 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 RBL1P28749 1068 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 SLC8A1P32418 973 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 RPL22P35268 128 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 ARL2P36404 184 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 SULT1E1P49888 294 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 ANKRD22Q5VYY1 191 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 NUDCD3Q8IVD9 361 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 C3orf20Q8ND61 904 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 DNAJB3Q8WWF6 145 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 TWNKQ96RR1 684 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 HAPLN2Q9GZV7 340 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 RSAD1Q9HA92 442 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 MYH4Q9Y623 1939 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 TXNDC9O14530 226 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 CBX6O95503 412 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 DRG2P55039 364 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 SEPT6Q14141 434 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 TCP10LQ8TDR4 215 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 CDKL2Q92772 493 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 GPR20Q99678 358 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 CYP4F11Q9HBI6 524 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 TXLNGQ9NUQ3 528 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 WDR35Q9P2L0 1181 aa13.09□□□□□ -0.31
UBXN4-201ENST00000272638 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms