RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 SCN4BQ8IWT1 228 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 CCDC13Q8IYE1 715 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 SDCCAG3Q96C92 435 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 MMP3P08254 477 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 ODC1P11926 461 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 NR1D1P20393 614 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 CYP2B6P20813 491 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 VPS41P49754 854 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 PTK6Q13882 451 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 KSR1Q8IVT5 923 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 ANKRD42Q8N9B4 389 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 TUBB6Q9BUF5 446 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 GOLGA8SH3BPF8 625 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 SLC10A3P09131 477 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 OCM2P0CE71 109 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 TGM2P21980 687 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 SERPINB9P50453 376 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 NAB1Q13506 487 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 SLC51AQ86UW1 340 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 IRGQQ8WZA9 623 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 SERPINB12Q96P63 405 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
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PTPN3-201ENST00000262539 NFU1Q9UMS0 254 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 SGPL1O95470 568 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 CST5P28325 142 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 XRCC4Q13426 336 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 DRP2Q13474 957 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 LY6KQ17RY6 165 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPN3-201ENST00000262539 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 UBXN6Q9BZV1 441 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 MTMR12Q9C0I1 747 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 FETUBQ9UGM5 382 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 CLCA2Q9UQC9 943 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 NR2C2P49116 596 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 STRADAQ7RTN6 431 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 ANKRD52Q8NB46 1076 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPN3-201ENST00000262539 CXorf38Q8TB03 319 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPN3-201ENST00000262539 SEPT8Q92599 483 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 HDAC6Q9UBN7 1215 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 SGK1O00141 431 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 UNGP13051 313 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 PSEN1P49768 467 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPN3-201ENST00000262539 SEC14L1Q92503 715 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPN3-201ENST00000262539 BFARQ9NZS9 450 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPN3-201ENST00000262539 FDFT1P37268 417 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPN3-201ENST00000262539 TFDP3Q5H9I0 405 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPN3-201ENST00000262539 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 CYFIP2Q96F07 1278 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF670Q9BS34 389 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 BCO2Q9BYV7 579 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 PTPRHQ9HD43 1115 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 SAGE1Q9NXZ1 904 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 O00370 1275 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 ZBTB39O15060 712 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 TFRCP02786 760 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 ADCYAP1R1P41586 468 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 GJA9P57773 515 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 IL9RQ01113 521 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 UGP2Q16851 508 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 DNAAF3Q8N9W5 541 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 SLC4A11Q8NBS3 891 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 LRGUKQ96M69 825 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 TRPC7Q9HCX4 862 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPN3-201ENST00000262539 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
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PTPN3-201ENST00000262539 RASSF10A6NK89 507 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPN3-201ENST00000262539 THP07101 528 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPN3-201ENST00000262539 PMLP29590 882 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPN3-201ENST00000262539 MAP2K2P36507 400 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPN3-201ENST00000262539 ETFBP38117 255 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPN3-201ENST00000262539 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPN3-201ENST00000262539 GRIK3Q13003 919 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPN3-201ENST00000262539 KCTD6Q8NC69 237 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPN3-201ENST00000262539 FGD4Q96M96 766 aa8.58□□□□□ -1.04
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